脓毒症-3文本时间序列语料库

基于2139份病例报告构建的脓毒症文本时间序列语料库,用于临床事件时间定位与轨迹分析。

卡内基梅隆大学卡内基梅隆大学
arXiv
2025-04-12 更新
浏览 59
文本脓毒症文本
Textual Time Series Corpus for Sepsis-3 (T2S2)

基本信息

模态
文本
创建/更新时间
2025-04-12

资源简介

该数据集由卡内基梅隆大学和NIH国家图书馆医学部合作构建,包含2139份来自Pubmed开放获取子集的病例报告,通过大型语言模型处理,生成与时间关联的文本时间序列,用于定位临床事件时间,支持脓毒症轨迹分析和疾病预测。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

该数据集由卡内基梅隆大学和NIH国家图书馆医学部合作构建,包含2139份来自Pubmed开放获取子集的病例报告,通过大型语言模型处理,生成与时间关联的文本时间序列,用于定位临床事件时间,支持脓毒症轨迹分析和疾病预测。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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