肯尼亚抗疟药耐药标志物范围综述（1987–2022）复现数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.7910/DVN/OGABW0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 29.6 MB。

数据说明

本复现包包含研究《肯尼亚抗疟药物耐药标志物的范围综述（1987—2022）：迈向国家监测框架与数据存储库》中使用的所有数据、脚本和输出。该存储库提供了一个可复现的工作流程，用于对肯尼亚已发表的恶性疟原虫抗疟药物耐药性分子监测数据进行识别、提取、标准化、分析和可视化。本包包括：01-scripts 用于数据清洗、协调、分析、制图和图形生成的R脚本。02-search terms 跨文献数据库使用的检索策略。03-studies 来自PubMed、Embase、Scopus、Web of Science和Google Scholar的文献记录和检索到的研究。04-extracted-data 整理后的数据集，包含从符合条件的研究中提取的等位基因频率、微单倍型频率和制图信息。05-output 可复现的分析输出，包括论文中呈现的表格、图形、地图和汇总数据集。06-mapping 用于生成空间可视化的地理参考文件和shapefile文件。

该存储库汇总了110项已发表研究的数据，可作为疟疾分子监测、耐药性监测以及未来肯尼亚国家抗疟药物耐药性数据存储库建设的可重复资源。目录结构：01-脚本 02-检索词 03-研究 embase google-scholar pubmed scopus web-of-science 04-提取数据 基因型-等位基因 基因型-微单倍型 crt dhfr dhfr-dhps dhps mdr1 制图 05-输出 等位基因 数据点 图表 地图 微单倍型 表格 等位基因 数据点 单倍型 06-制图 01-矢量数据文件 ken_adm_iebc_20191031_shp ken_lakes kenya-sublocations

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。