PXD015857:曼氏血吸虫来源两类细胞外囊泡(外泌体样囊泡与微囊泡)的蛋白质组学分析

胞外囊泡已从多种寄生蠕虫中鉴定,近期实验证据支持其货物在宿主—寄生虫关系中具重要功能。本研究对曼氏血吸虫的两种胞外囊泡——外泌体样囊泡和微囊泡——开展详细蛋白质组学分析,采用LC-MS/MS(TripleTOF 6600)分析其中蛋白,包括外部胰蛋白酶释放肽、货物蛋白、整合膜蛋白和周边膜蛋白(来源

pride
2019-10-17 更新
浏览 16
蛋白质分类Schistosoma mansoniProteomicsExosome-like vesiclesMicrovesiclesExtracellular vesicles
PXD015857: Proteomic analysis of two populations of Schistosoma mansoni-derived extracellular vesicles: exosome-like vesicles and microvesicles

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-10-17

资源简介

PXD015857:曼氏血吸虫来源两类细胞外囊泡(外泌体样囊泡与微囊泡)的蛋白质组学分析

胞外囊泡已从多种寄生蠕虫中鉴定,近期实验证据支持其货物在宿主—寄生虫关系中具重要功能。本研究对曼氏血吸虫的两种胞外囊泡——外泌体样囊泡和微囊泡——开展详细蛋白质组学分析,采用LC-MS/MS(TripleTOF 6600)分析其中蛋白,包括外部胰蛋白酶释放肽、货物蛋白、整合膜蛋白和周边膜蛋白(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):细胞外囊泡(EVs)已在多种寄生蠕虫中被鉴定,并且近期的实验证据支持其货物在宿主-寄生虫关系中具有重要功能。在此,我们对来自曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni)的两个EV群体——外泌体样囊泡(ELVs)和微囊泡(MVs)——进行了详细的蛋白质组学分析。我们利用LC-MS/MS分析了这些EV中存在的蛋白质,包括外部经胰蛋白酶释放的肽、货物蛋白、整合膜蛋白(IMPs)和外周膜蛋白(PMPs)。

【主题与分类】

主题标签:Schistosoma mansoni、Proteomics、Exosome-like vesicles、Microvesicles、Extracellular vesicles。本站分类:感染/寄生虫病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015857

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞外囊泡(EVs)已在多种寄生蠕虫中被鉴定,并且近期的实验证据支持其货物在宿主-寄生虫关系中具有重要功能。在此,我们对来自曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni)的两个EV群体——外泌体样囊泡(ELVs)和微囊泡(MVs)——进行了详细的蛋白质组学分析。我们利用LC-MS/MS分析了这些EV中存在的蛋白质,包括外部经胰蛋白酶释放的肽、货物蛋白、整合膜蛋白(IMPs)和外周膜蛋白(PMPs)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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