PXD005335：恶性疟原虫无性血液期与配子体的ATPase活性
数据围绕恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）无性血液期与配子体阶段，刻画与配子体生成相关的ATPase活性，涉及基于活性的蛋白质组学（Activity-based proteomics）与ATPase主题
基本信息
资源简介
PXD005335：恶性疟原虫无性血液期与配子体的ATPase活性
PXD005335 数据集聚焦于恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）在无性血液期与配子体阶段中与配子体生成相关的 ATPase 活性，主题涵盖疟疾、基于活性的蛋白质组学以及 ATPase。该数据集来源于 ebi.ac.uk，在感染 / 寄生虫病分类下提供，旨在刻画恶性疟原虫配子体生成过程中 ATPase 活性的特征。整体而言，该数据集为研究疟原虫在无性血液期向配子体阶段转变过程中的酶活性变化提供了蛋白质组学层面的资源，有助于理解 ATPase 在配子体生成中的潜在作用。
【数据集背景】
恶性疟原虫是疟疾的主要病原体之一，其生活史包括在人体内的无性血液期和在蚊体内的有性生殖阶段。配子体生成是疟原虫从无性增殖向有性发育转变的关键过程，这一过程涉及多种酶活性的调控。ATPase 作为一类催化 ATP 水解的酶，在细胞能量代谢和信号传导中发挥重要作用。该数据集以恶性疟原虫为研究对象，关注无性血液期与配子体阶段中与配子体生成相关的 ATPase 活性，利用基于活性的蛋白质组学方法进行表征。源站描述指出，该数据集旨在表征与恶性疟原虫配子体生成相关的 ATPase 活性。主题标签包括疟疾、基于活性的蛋白质组学、ATPase，以及恶性疟原虫的 NEWT 分类标识（NEWT:5833）。这些信息共同构成了该数据集的生物学背景和研究焦点。
【数据内容】
该数据集围绕恶性疟原虫无性血液期与配子体阶段，刻画与配子体生成相关的 ATPase 活性。其核心内容涉及基于活性的蛋白质组学（Activity-based proteomics）方法所获取的数据，主题标签明确包含 ATPase 和疟疾。数据集英文名称为“PXD005335: ATPase activity in Plasmodium falciparum asexual blood stages and gametocytes”，直接反映了其研究范围：恶性疟原虫无性血液期和配子体中的 ATPase 活性。源站描述进一步说明，该数据集用于表征与配子体生成相关的 ATPase 活性。关于具体的样本数量、实验条件、检测到的 ATPase 种类或活性数值等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于感染 / 寄生虫病分类。其来源站为 EBI（欧洲生物信息学研究所），数据集标识为 PXD005335。源站描述提供了该数据集的简要说明，即表征与恶性疟原虫配子体生成相关的 ATPase 活性。主题标签中包含了 NEWT 分类标识 NEWT:5833，对应恶性疟原虫，以及 MS 分类标识（MS:10004，具体名称未完整给出）。关于样本采集地点、时间、实验操作流程、仪器型号等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于疟疾相关研究，尤其是针对恶性疟原虫配子体生成过程中 ATPase 活性的探索。基于活性的蛋白质组学方法使其可用于分析酶活性变化，帮助研究者理解配子体生成这一关键发育阶段的分子机制。潜在应用包括：比较无性血液期与配子体阶段 ATPase 活性的差异，筛选与配子体生成相关的 ATPase 候选分子，以及为抗疟药物靶点发现提供线索。此外，该数据集也可用于蛋白质组学方法学参考，尤其是在基于活性的蛋白质组学实验设计与数据分析方面。由于主题标签涉及疟疾和寄生虫病，它还可服务于感染性疾病领域的比较研究和数据整合。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取，具体访问路径和下载方式需参考该站点的相关说明。使用时可结合基于活性的蛋白质组学数据特点，进行 ATPase 活性相关的定性和定量分析。由于数据集标识为 PXD005335，用户可在蛋白质组学数据平台中检索该标识以获取原始数据或相关元数据。关于数据格式、文件结构、分析工具推荐等具体使用指南，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于公共数据资源，但其具体质量指标（如数据完整性、重复性、覆盖率等）源站未提供。限制方面，由于源站描述较为简短，缺乏关于实验设计、样本量、统计方法等详细信息，用户在使用时需自行评估数据适用性。此外，该数据集仅针对恶性疟原虫的 ATPase 活性，不涵盖其他寄生虫或酶类，适用范围有限。关于数据的具体限制和注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议及使用条款源站未提供。用户在使用时应遵循来源站 ebi.ac.uk 的相关规定，并建议在发表成果时引用原始数据集标识 PXD005335 及来源站点。关于具体的引用格式和许可类型，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005335
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Characterization of ATPase activity associated with gametocytogenesis in P. falciparum
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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