微小牛蜱幼虫、成蜱卵巢与雌蜱肠道中与B bovis感染相关的表达基因微阵列分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-10816

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

牛巴贝虫暴露组织：共观察了三种组织。1. 成年雌性肠道 2. 成年卵巢 3. 幼虫。总共对特征（EST）进行了24次测量，6个处理组中每组每个处理有4次测量。6个处理组分别为：肠道感染组（GI）、肠道对照组（GC），卵巢和幼虫同样对应为：OI、OC、LI、LC。共有12张芯片，每张芯片设有一个点样重复。**注：联系人：Felix D. Guerrero 电子邮件：felix.guerrero@ars.usda.gov 关键词：微小扇头蜱（Rhipicephalus (Boophilus) microplus）、巴贝虫、微阵列。在本研究所呈现的内容中，共进行了12次杂交。分析了13601个独特EST的表达谱。未感染蜱与感染蜱分别以单批次收集。所进行的重复为技术重复。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。