T. cruzi 感染 MC57G 小鼠成纤维细胞的免疫肽组学

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.3r2280gnx

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数据说明

克氏锥虫是一种原生动物寄生虫，可引起恰加斯病。全球有600万至700万人感染这种寄生虫，其中20-30%将发展为慢性恰加斯心肌病（CCC）。尽管疾病负担沉重，但目前尚无临床批准的疫苗可用于预防或治疗CCC。开发能够刺激克氏锥虫特异性CD8+细胞毒性T细胞并消除感染细胞的疫苗，需要靶向呈递于主要组织相容性复合体I类（MHC-I）分子上的寄生虫抗原。我们利用基于质谱的免疫肽组学来研究克氏锥虫感染细胞的MHC-I上呈递了哪些寄生虫肽。用克氏锥虫锥鞭毛体Tulahuen株感染小鼠MC57G成纤维细胞。48小时后，洗去细胞外寄生虫，收获克氏锥虫感染的成纤维细胞。分离呈递于主要组织相容性复合体I类（MHC-I）上的肽，并使用ThermoScientific Orbitrap Eclipse仪器通过质谱进行分析。蛋白质组数据库T。

克氏锥虫CL Brener株（https://www.uniprot.org/proteomes/UP000002296）和C57BL/6小鼠（https://www.uniprot.org/proteomes/UP000000589）被用于肽段鉴定。在此数据集中，实验#1和#2代表了来自克氏锥虫感染的MC57G成纤维细胞肽段的质谱分析原始数据。实验#3包含了未感染的MC57G细胞作为对照的数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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