克氏锥虫感染MC57G小鼠成纤维细胞的免疫肽组学
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦克氏锥虫(Trypanosoma cruzi)感染小鼠 MC57G 成纤维细胞后的免疫肽组学分析

基本信息
资源简介
克氏锥虫感染MC57G小鼠成纤维细胞的免疫肽组学
Immunopeptidomics on T. cruzi â infected MC57G murine fibroblasts
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦克氏锥虫(Trypanosoma cruzi)感染小鼠 MC57G 成纤维细胞后的免疫肽组学分析。研究以 Tulahuen 株锥鞭毛体感染细胞,48 小时后去除胞外寄生虫并收集感染细胞,利用质谱技术鉴定呈递于 MHC-I 分子上的寄生虫来源肽段。数据可用于探索恰加斯病疫苗研发中 CD8+ 细胞毒性 T 细胞识别的抗原靶点,服务于寄生虫病感染免疫相关研究(来源 DataONE,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):克氏锥虫是一种引起恰加斯病的原生动物寄生虫。全球有600万至700万人感染该寄生虫,其中20-30%将进展为慢性恰加斯心肌病(CCC)。尽管疾病负担沉重,目前尚无临床批准的疫苗用于预防或治疗CCC。开发能够刺激克氏锥虫特异性CD8+细胞毒性T细胞并清除感染细胞的疫苗,需要靶向呈递于主要组织相容性复合体I类(MHC-I)分子上的寄生虫抗原。我们利用基于质谱的免疫肽组学来研究克氏锥虫感染细胞的MHC-I上展示了哪些寄生虫肽段。小鼠MC57G成纤维细胞被克氏锥虫Tulahuen株锥鞭毛体感染。48小时后,洗去胞外寄生虫并收集克氏锥虫感染的成纤维细胞。存在的肽段
【主题与分类】
主题标签:Chagas disease、Immunopeptidomics、Mass spectrometry、Trypanosoma cruzi、MHC class I。本站分类:感染/寄生虫病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A9023c7c009e67a0acd40857dafe47c3397d8f94995f3de67733acfa941d90bb4
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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- OpenDataLab:
数据说明
克氏锥虫是一种引起恰加斯病的原生动物寄生虫。全球有600万至700万人感染此寄生虫,其中20-30%将进展为慢性恰加斯心肌病(CCC)。尽管疾病负担沉重,目前尚无临床批准的疫苗用于预防或治疗CCC。开发能够刺激克氏锥虫特异性CD8+细胞毒性T细胞并清除感染细胞的疫苗,需要靶向呈递于主要组织相容性复合体I类(MHC-I)分子上的寄生虫抗原。我们利用基于质谱的免疫肽组学研究了克氏锥虫感染细胞的MHC-I上呈递了哪些寄生虫肽。用克氏锥虫锥鞭毛体Tulahuen株感染小鼠MC57G成纤维细胞。48小时后,洗去细胞外寄生虫,收获克氏锥虫感染的成纤维细胞。分离呈递于主要组织相容性复合体I(MHC-I)上的肽,并使用…通过质谱进行分析,# 关于T的免疫肽组学。
克氏锥虫*感染的MC57G小鼠成纤维细胞 https://doi.org/10.5061/dryad.3r2280gnx ## 描述 ###### 摘要 克氏锥虫是一种引起恰加斯病的原生动物寄生虫。全球有600万至700万人感染该寄生虫,其中20-30%将进展为慢性恰加斯心肌病(CCC)。尽管疾病负担沉重,目前尚无临床批准的疫苗用于预防或治疗CCC。开发能够刺激克氏锥虫特异性CD8+细胞毒性T细胞并清除感染细胞的疫苗,需要靶向呈递于主要组织相容性复合体I类(MHC-I)分子上的寄生虫抗原。我们利用基于质谱的免疫肽组学研究了克氏锥虫感染细胞的MHC-I上呈递了哪些寄生虫肽段。鉴定出十余种克氏锥虫肽段。 ###### 实验流程 小鼠MC57G成纤维细胞
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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