不同空间尺度下树洞蜱Ixodes arboricola的种群遗传结构数据
该数据集来自 Dryad,围绕树洞蜱 Ixodes arboricola 在不同空间尺度上的种群遗传结构展开。研究使用 7 个多态微卫星标记,采集了比利时安特卫普附近四个林地中 76 个巢箱内的 268 只蜱,这些巢箱主要由大山雀 Parus major 和蓝山雀 Cyanistes caerule

基本信息
资源简介
不同空间尺度下树洞蜱Ixodes arboricola的种群遗传结构数据
Data from: Population genetic structure of the tree-hole tick Ixodes arboricola (Acari: Ixodidae) at different spatial scales
该数据集来自 Dryad,围绕树洞蜱 Ixodes arboricola 在不同空间尺度上的种群遗传结构展开。研究使用 7 个多态微卫星标记,采集了比利时安特卫普附近四个林地中 76 个巢箱内的 268 只蜱,这些巢箱主要由大山雀 Parus major 和蓝山雀 Cyanistes caeruleus 使用。数据可用于分析蜱在巢箱内、巢箱间及林地间的遗传分化与亲缘关系,并探讨宿主活动对寄生虫扩散的影响(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2014。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):内生性蜱 Ixodes arboricola 寄生于洞巢鸟类,其扩散强烈依赖于宿主的移动。研究使用 7 个多态微卫星标记对 I. arboricola 的种群遗传结构进行了研究。我们从比利时安特卫普附近四个林地的 76 个巢箱中采集了 268 只蜱。这些巢箱主要被 I. arboricola 的主要宿主大山雀 Parus major 和蓝山雀 Cyanistes caeruleus 使用。由于这些鸟类通常会回到同一洞穴栖息或繁殖,巢箱内的蜱预计高度相关,且蜱种群预计在林地间以及林地内巢箱间具有空间结构。与预期一致,在林地间和林地内巢箱间发现了遗传种群结构。令人惊讶的是,蜱之间存在相当大的遗传变异
【主题与分类】
主题标签:relatedness、host-parasite interactions、null alleles、Ixodes arboricola。本站分类:感染/寄生虫病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.hb169
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.hb169
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- OpenDataLab:
数据集大小约 88.2 KB。
数据说明
内栖性蜱种树洞硬蜱侵扰洞巢鸟类,其扩散强烈依赖于宿主的移动。利用七个多态微卫星标记对树洞硬蜱的种群遗传结构进行了研究。我们从比利时安特卫普附近四个林地的76个巢箱中采集了268只蜱。这些巢箱主要被树洞硬蜱的主要宿主——大山雀Parus major和蓝山雀Cyanistes caeruleus所使用。由于这些鸟类通常会回到同一洞穴栖息或繁殖,预期巢箱内的蜱具有高度亲缘关系,且蜱种群在林地之间以及林地内巢箱之间应呈现空间结构。与预期一致,在林地之间和林地内巢箱之间均发现了遗传种群结构。出乎意料的是,巢箱内蜱之间存在相当大的遗传变异。这可能是由于来自附近树洞蜱的持续基因流所致,但这仍有待验证。
对巢箱内所有蜱虫配对进行的配对亲缘关系分析显示,幼虫间的亲缘关系远高于后期龄期,这表明幼虫是蜱虫扩散的最重要龄期。总体而言,所研究空间尺度上的蜱虫种群分化程度并未如预测那般显著,这可能影响宿主-寄生虫进化发生的尺度。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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