Anopheles gambiae微卫星标记应用于近缘种Anopheles melas的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.tg3d788k

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数据集大小约 170.5 KB。

数据说明

米拉按蚊是一种在非洲西部沿海地区发现的咸水蚊种，当地是主要的疟疾传播媒介。为了促进对该物种的遗传学研究，最初为冈比亚按蚊开发的45个微卫星位点在米拉按蚊中进行了测序。根据重复序列数量及侧翼区域判断为合适的位点，在来自赤道几内亚的2个自然种群中进行了检验。最终仅有15个位点被认为适合作为米拉按蚊种群的多态性标记。这些位点在更广泛地理范围内的4个种群中进行了筛选。杂合度估计范围从0.18到0.79，每个位点观察到的平均等位基因数为2.5至15，从而产生了13个高度多态性标记和2个变异较低的位点。为了探究微卫星标记在近缘种应用中的有效性，使用原本针对冈比亚按蚊的特异性标记来扩增米拉按蚊的5个位点。结果发现，有1个冈比亚按蚊标记存在无效等位基因。

我们探讨了在近缘物种间使用微卫星位点的陷阱，并得出结论：除了与此做法相关的无效等位基因问题外，许多位点即使在姊妹种中使用，也可能证明作为多态性标记的用途极为有限。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。