蝙蝠血孢子虫传播研究数据:寄生虫、媒介与宿主的遗传结构比较
基于微卫星分析,比较三者遗传距离矩阵,发现无翅媒介种群结构最弱,应视为活动性最强的宿主。数据可用于寄生虫-媒介-宿主协同分化、种群遗传结构与传播生态研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)

基本信息
资源简介
蝙蝠血孢子虫传播研究数据:寄生虫、媒介与宿主的遗传结构比较
Data from: How a haemosporidian parasite of bats gets around: the genetic structure of a parasite, vector and host compared
该数据集来自对蝙蝠血孢子虫 Polychromophilus melanipherus 及其蝙蝠蝇媒介 Nycteribia schmidlii 和宿主 Miniopterus schreibersii 的欧洲范围采样研究。基于微卫星分析,比较三者遗传距离矩阵,发现无翅媒介种群结构最弱,应视为活动性最强的宿主。数据可用于寄生虫-媒介-宿主协同分化、种群遗传结构与传播生态研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2015。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):寄生虫的种群结构通常被认为主要由其宿主塑造。对于具有复杂生活史的寄生虫,两个宿主物种各自具有不同的人口学和迁移模式,共同传播寄生虫。然而,预测寄生虫的种群结构仅与活动性最强的宿主物种相似。本研究在媒介传播寄生虫的背景下检验了这一预测。我们在欧洲范围内采样了血孢子虫寄生虫 Polychromophilus melanipherus,以及其蝙蝠蝇媒介 Nycteribia schmidlii 和宿主 Miniopterus schreibersii。基于微卫星分析,无翅媒介而非蝙蝠宿主被鉴定为结构最弱的种群,因此应被视为活动性最强的宿主。对三个物种的遗传距离矩阵进行了比较。
【主题与分类】
主题标签:Hippoboscoidea、Polychromophilus melanipherus、Haemosporida、Nycteribiidae、heteroxenous parasite、Malaria、codifferentiation、Miniopterus schreibersii、Coevolution、Nycteribia schmidlii。本站分类:感染/寄生虫病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.2m1p0
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.2m1p0
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- OpenDataLab:
数据集大小约 418.6 KB。
数据说明
寄生虫的种群结构常被认为在很大程度上由其宿主的种群结构所决定。对于具有复杂生活史的寄生虫而言,两种宿主各自具有不同的种群动态与迁徙模式,共同传播该寄生虫。然而,预测寄生虫的种群结构仅与最具扩散能力的宿主物种相似。本研究以一种媒介传播的寄生虫为对象,检验了这一预测。我们在欧洲范围内采样了血孢子虫寄生虫Polychromophilus melanipherus,以及其蝙蝠蝇媒介Nycteribia schmidlii和宿主——长翼蝠Miniopterus schreibersii。基于微卫星分析,无翅的媒介昆虫而非蝙蝠宿主被鉴定为种群结构最弱的群体,因此应被视为最具扩散能力的宿主。我们基于线粒体DNA片段比较了三个物种的遗传距离矩阵。宿主和媒介种群在地中海地区均呈现距离隔离模式,而寄生虫则不然。Mantel检验未发现寄生虫与宿主或媒介种群之间存在相关性。
因此,我们未能找到支持假设的证据;寄生虫种群结构既不匹配媒介也不匹配宿主。相反,我们提出一个模型,其中寄生虫的基因流动由宿主和媒介扩散模式的叠加效应所体现。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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