脑脊液蛋白质组图谱检测脑膜炎病原体特异性宿主反应模式数据

主题标签:感染、脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、宿主反应、病原体。本数据集为感染领域公开数据集,主题涵盖感染。本数据集为感染领域的蛋白质公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖感染。

google_dataset
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蛋白质分类感染脑膜炎脑脊液蛋白质组宿主反应病原体
Data from: Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

脑脊液蛋白质组图谱检测脑膜炎病原体特异性宿主反应模式数据

该数据集英文名为 Data from: Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis,来自 EBI(ebi.ac.uk)公开数据资源,属于感染 / 脑膜炎分类下的公开数据集。其主题涵盖感染、脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、宿主反应与病原体等方向,核心内容围绕脑脊液蛋白质组图谱展开,用于呈现脑膜炎中病原体特异性的宿主反应模式。该数据集由 Anahita Bakochi 于 2021 年发布,源站描述中标注为数据集,并提供了其在 PRIDE 档案中的项目编号 PXD023174。整体而言,该数据集面向感染领域,尤其是脑膜炎相关的蛋白质组研究,为探索脑脊液中的宿主反应特征提供了公开可用的数据资源。

【数据集背景】

该数据集属于感染领域,具体聚焦于脑膜炎。脑膜炎是一类涉及中枢神经系统感染的疾病,其病原体种类多样,宿主对感染的响应机制复杂。该数据集以脑脊液蛋白质组图谱为核心,旨在检测脑膜炎中病原体特异性的宿主反应模式。从标题和主题标签来看,研究关注的是通过脑脊液蛋白质组信息区分不同病原体引发的宿主反应差异。该数据集由 Anahita Bakochi 于 2021 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,属于公开数据集,分类归入感染 / 脑膜炎方向。其主题标签包括感染、脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、宿主反应和病原体,这些标签共同界定了该数据集的基本领域和关注重点。

【数据内容】

该数据集的内容为脑脊液蛋白质组图谱,用于检测脑膜炎中病原体特异性的宿主反应模式。从主题标签可知,数据涉及脑脊液、蛋白质组、宿主反应和病原体等要素。数据集英文名称明确指向“Cerebrospinal fluid proteome maps”与“pathogen-specific host response patterns in meningitis”,说明其内容围绕脑脊液蛋白质组展开,并用于分析不同病原体感染下的宿主反应特征。该数据集属于感染领域公开数据集,主题涵盖感染。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、病原体种类清单等详细数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中注明:Anahita Bakochi (2021). Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD023174。由此可知,该数据集发布于 EBI 的 PRIDE 档案,项目编号为 PXD023174,发布年份为 2021 年,发布者为 Anahita Bakochi。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息、样本纳入与排除标准等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染领域,尤其是脑膜炎相关的研究场景。其主题标签涵盖感染、脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、宿主反应和病原体,因此可用于探索脑脊液蛋白质组在脑膜炎宿主反应研究中的应用,也可用于关注病原体特异性宿主反应模式的分析场景。作为公开数据集,它可服务于蛋白质组学、感染性疾病研究以及脑脊液相关生物标志物探索等方向。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、疫苗评价等具体应用,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,并在 PRIDE 档案中以项目编号 PXD023174 发布。使用者可通过源站描述中提供的链接访问该数据集页面。关于数据下载方式、文件格式、数据处理流程、分析工具、软件参数等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 2021 年发布的公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,发布者为 Anahita Bakochi,项目编号为 PXD023174。其主题标签包括感染、脑膜炎、脑脊液、蛋白质组、宿主反应和病原体。关于数据质量评估、样本量大小、覆盖度、技术偏差、验证程度、局限性说明等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Anahita Bakochi (2021). Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD023174。关于该数据集的许可条款、使用限制、再分发条件等具体信息,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD023174

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Anahita Bakochi (2021). Cerebrospinal fluid proteome maps detect pathogen-specific host response patterns in meningitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD023174

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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