大菱鲆头肾中性粒细胞PBS或β-glucan训练后7天RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320500

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集展示了在训练后第7天（7 dpt）从大菱鲆头肾中分离的中性粒细胞的RNA测序（RNA-seq）分析。取两个实验组——PBS对照组和β-葡聚糖训练组——的头肾组织，处理后制备中性粒细胞悬液。使用NEBNext Ultra™ RNA Library Prep Kit（NEB #E7490）构建文库，并用磁珠（AMPure XP系统）纯化。测序在NovaSeq 6000平台上进行，采用PE150。使用的基因组版本为hg38_V43_gencode。本研究呈现了β-葡聚糖训练介导的中性粒细胞转录图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。