人Molm13细胞COX4I1 CRISPR敲除的RNA-seq
可用于比较COX4I1敲除与对照细胞的转录组差异，探索COX4I1在Molm13细胞中的功能及相关感染性疾病机制（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
人Molm13细胞COX4I1 CRISPR敲除的RNA-seq
GSE261970 是一个聚焦于人类 Molm13 细胞中 COX4I1 基因功能的 RNA-seq 数据集。该数据集通过 CRISPR 敲除技术构建 COX4I1 缺失的细胞模型，并利用高通量测序对基因表达谱进行检测，旨在揭示 COX4I1 敲除后转录组层面的变化。数据集来源于 NCBI，标题为“RNA-seq in human Molm13 cells with CRISPR knockout of COX4I1”，作者为 Chun-Wei Chen，发布时间为 2024 年 3 月 19 日。本站将其归类于感染 / 感染性疾病领域，提示该数据集可能与感染相关疾病机制的研究有关。数据集仅包含一个文件，即 GSE261970_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件，可供研究者下载后分析 COX4I1 敲除与对照细胞之间的转录组差异。
【数据集背景】
COX4I1 是细胞色素 c 氧化酶复合物的一个亚基，参与线粒体呼吸链的组装与功能调控。Molm13 是人类急性髓系白血病细胞系，常用于血液系统疾病及感染相关免疫机制的研究。该数据集通过 CRISPR 基因编辑技术敲除 Molm13 细胞中的 COX4I1，并利用 RNA-seq 技术进行全转录组表达谱分析，以探索该基因在 Molm13 细胞中的生物学功能及其在感染性疾病中的潜在作用。源站描述指出，该数据集旨在检测 COX4I1 敲除对人 Molm13 细胞基因表达谱的影响。
【数据内容】
数据集包含一个文件：GSE261970_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩的系列矩阵文件，通常包含样本表达值、样本注释信息以及平台信息等。主题标签显示该数据属于“Expression profiling by high throughput sequencing”，平台编号为 GPL24676，物种分类号为 9606（即人类）。文件数量为 1，表明该数据集以单一矩阵文件的形式提供所有样本的表达数据。数据内容可用于比较 COX4I1 敲除组与对照组细胞之间的基因表达差异，进而分析受 COX4I1 调控的靶基因和信号通路。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（美国国家生物技术信息中心），源站标题为“RNA-seq in human Molm13 cells with CRISPR knockout of COX4I1”。作者为 Chun-Wei Chen，发布时间为 2024 年 3 月 19 日。实验对象为人类 Molm13 细胞，采用 CRISPR 技术敲除 COX4I1 基因，随后进行 RNA-seq 测序。测序平台为 GPL24676，属于高通量测序平台。数据以系列矩阵文件形式发布，供研究者下载使用。源站未提供具体的样本数量、测序深度、读长、比对软件等实验细节。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究场景：比较 COX4I1 敲除与对照 Molm13 细胞的转录组差异，识别差异表达基因；探索 COX4I1 在 Molm13 细胞中的功能及其调控网络；结合感染 / 感染性疾病背景，分析 COX4I1 在感染相关机制中的潜在作用；作为高通量测序表达谱数据，可用于方法学验证或与其他数据集进行整合分析。侧写线索指出，该数据可用于探索 COX4I1 在 Molm13 细胞中的功能及相关感染性疾病机制。
【使用方法】
使用者可下载数据文件 GSE261970_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。该文件通常包含表达矩阵和样本元数据，可使用常规转录组分析工具进行差异表达分析、聚类分析或通路富集分析。由于文件为压缩格式，需先解压或使用支持 GZIP 的读取函数加载。源站未提供具体的分析流程或代码。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估的详细信息，如测序质量分数、重复性、批次效应等。数据集仅包含一个文件，可能限制了对原始测序读长或比对文件的直接获取。此外，源站未提供样本数量、生物学重复数、对照设置等关键实验设计信息，使用者需谨慎解读结果。该数据集基于 Molm13 细胞系，结论外推到其他细胞类型或体内环境时需进一步验证。本站分类为感染 / 感染性疾病，但源站描述未明确说明与感染性疾病的具体关联机制。
【引用与许可】
源站未提供具体的引用格式或许可条款。使用者应遵循 NCBI 及原数据发布者的使用政策，在发表成果时引用作者 Chun-Wei Chen 及数据集标题“RNA-seq in human Molm13 cells with CRISPR knockout of COX4I1”。源站未提供许可信息，建议直接访问 NCBI 页面获取最新授权说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261970
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集研究了COX4I1敲除对人Molm13细胞基因表达谱（RNA-seq）的影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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