抗生素间的附带敏感性交互取决于局部非生物条件

该数据集来自 search.dataone.org,属于感染/感染性疾病分类,围绕抗生素之间的附带敏感性交互展开。研究使用五种抗生素分离并表征 Escherichia coli 耐药突变体,随后测量其对其他配对 antibiotic 耐药性的附带效应,并在分离与表型测定中改变 pH、温度、胆汁等自然

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基因组回归Escherichia coli K-12linear mixed modelscollateral sensitivityGenome resequencing
Collateral sensitivity interactions between antibiotics depend on local abiotic conditions

基本信息

模态
基因组
任务类型
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许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

抗生素间的附带敏感性交互取决于局部非生物条件

Collateral sensitivity interactions between antibiotics depend on local abiotic conditions

该数据集来自 search.dataone.org,属于感染/感染性疾病分类,围绕抗生素之间的附带敏感性交互展开。研究使用五种抗生素分离并表征 Escherichia coli 耐药突变体,随后测量其对其他配对 antibiotic 耐药性的附带效应,并在分离与表型测定中改变 pH、温度、胆汁等自然界相关条件。数据可用于分析局部非生物条件如何影响耐药性表达及附带敏感性,支撑耐药进化与抗生素组合治疗的建模研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):赋予一种抗生素耐药性的突变可能增加(交叉耐药)或降低(附带敏感性)对其他抗生素的耐药性。表现出附带敏感性的抗生素组合可用于减缓耐药性进化的治疗。然而,从实验室到临床的转化需要了解附带效应在不同环境条件下是否稳健。在这里,我们使用五种抗生素分离并表征了大肠杆菌的耐药突变体,然后测量了对其他配对 antibiotic 耐药性的附带效应。在分离和表型测定过程中,我们以自然界相关的方式改变了条件(pH、温度、胆汁)。这揭示局部非生物条件改变了对分离期间所用 antibiotic 和其他 antibiotic 的耐药性表达。因此,局部条件影响了附带敏感性在

【主题与分类】

主题标签:Escherichia coli K-12、linear mixed models、collateral sensitivity、Genome resequencing。本站分类:感染/感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A8f366b840bc30ab18596a40b13be22ad017bb7f4b5dc98131c74379cd3bb166c

使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

赋予对一种抗生素耐药性的突变,可能增加(交叉耐药性)或降低(附带敏感性)对其他抗生素的耐药性。表现出附带敏感性的抗生素组合可用于减缓耐药性进化的治疗中。然而,从实验室到临床的转化需要了解附带效应在不同环境条件下是否稳健。在此,我们使用五种抗生素分离并表征了大肠杆菌的耐药突变体,随后测量了其对其他配对 antibiotic 耐药性的附带效应。在分离和表型分析过程中,我们以自然界相关的方式改变了条件(pH、温度、胆盐)。这揭示出局部非生物条件改变了对分离期间所用抗生素及其他抗生素的耐药性表达。因此,局部条件以两种方式影响附带敏感性:通过有利于不同的突变体集合(具有不同的附带敏感性),以及通过 m……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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