T300A SNP与COVID-19严重程度的关联：Norfolk队列与UK Biobank

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/9sd2mkvg7m.1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 10.4 MB。

数据说明

自噬是一种与抵御病毒感染相关的先天途径。我们此前的工作发现，自噬蛋白ATG16L1的突变对小鼠流感病毒感染具有深远影响。本研究探讨ATG16L1基因多态性在人类COVID-19发病机制中的作用。ATG16L1由两个结构域组成，即N端CCD和C端WD重复结构域，二者由一个延伸且不稳定的连接区隔开。连接区中一个常见SNP——T300A（rs2241880）——被认为编码一个caspase 3位点，从而使WD结构域被切除。T300A SNP与炎症性疾病（如克罗恩病）风险增加相关。本研究在本地诺福克队列和两个大型英国生物样本库队列中，探讨了人类ATG16L1 T300A SNP与COVID-19临床症状之间的关联。在全部3个队列中，T300A纯合子表现出某些症状频率降低，并对轻症而非重症COVID-19感染具有保护作用。在重症组中，T300A纯合子表现出发热、胸痛和呼吸短促增加。此外，T300A纯合子的抗病毒抗体产生减少。

这可能是由于ATG16L1 T300A通过LC3相关吞噬作用参与抗原呈递所致。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。