高山树蛙对壶菌病真菌感染的生存、基因与代谢响应数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A30f4016ea9aadeec4e6d608d8cdd52a77a45982f2f8abaaac12df914c7ec4822

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

请注意，这些数据在另一篇出版物中也有引用。请参见 http://dx.doi.org/10.1111/mec.14493。真菌性皮肤病——壶菌病已导致全球数百种两栖动物物种灾难性减少和灭绝，但进化出抗性的潜力及其潜在的病理生理机制仍知之甚少。我们在两项同时进行的对照感染实验中，将来自多个种群（其中一个种群在进化上对壶菌病无经验）的406只未接触过病原体、人工饲养的高山树蛙（Litoria verreauxii alpina）暴露于病原体Batrachochytrium dendrobatidis。我们研究了（A）各种群和窝次之间的生存结果和临床病原体负荷，以及（B）个体宿主组织对壶菌病的反应。在此，我们展示了与这些暴露实验相关的多个相互关联的数据集，包括来自实验A的355只动物的动物信号特征、生存和病原体负荷，以及以下……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。