养鱼场资源环境促进机会性鱼类病原体表型变异与毒力

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A40966eddf153475ba2277e31737eea0ef272ad2cd637a500e90ca4525fc682bd

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表型变异被认为有助于在环境变化下持续存在环境生长的病原体。我们在此假设，集约化养殖环境比自然环境诱导微生物病原体产生更高的表型变异，因为与自然环境相比，养殖环境具有更高的生长随机性和更强的生存选择。我们利用从养鱼场或自然水体中分离的机会性鱼类病原体柱状黄杆菌（Flavobacterium columnare）检验了这一假设。我们测量了所有分离株的两种形态型在不同资源浓度和与养殖场疾病流行发生相关的两种温度下的生长参数，并使用斑马鱼（Danio rerio）感染模型测试了它们的毒力。根据我们的假设，源自养鱼场的分离株在形态型之间的生长表型变异高于来自自然水体的分离株。这种差异在高度…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。