PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的SAGE转录谱
该数据集来自ebi.ac.uk,采用SAGE技术对猪肺泡巨噬细胞(PAMs)在感染PRRSV毒株VR-2332后的转录组变化进行时间序列分析

基本信息
资源简介
PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的SAGE转录谱
PRRSV-infection of porcine alveolar macrophages
该数据集来自ebi.ac.uk,采用SAGE技术对猪肺泡巨噬细胞(PAMs)在感染PRRSV毒株VR-2332后的转录组变化进行时间序列分析。细胞以MOI为10感染,在感染后6、12、16或24小时收集总RNA,同时包含未感染对照,每个SAGE文库测序至少95,000个标签。数据覆盖感染过程多个时间点的基因表达谱,可用于研究PRRSV感染导致细胞功能下降和免疫抑制的分子机制,支持差异表达分析与感染状态分类等任务(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究的目的是对正常猪肺泡巨噬细胞(PAMs)感染PRRSV后发生的基因表达变化进行深入、全局性的分析。目标是检查基因表达变化,以帮助确定导致PRRSV感染猪中观察到的功能降低和免疫抑制的机制。关键词:感染时间进程。PAMs在培养中以MOI为10感染PRRSV毒株VR-2332,并在37C下孵育至感染后6、12、16或24小时。在适当时间从每个样本中收集总细胞RNA。从每个感染时间点以及未感染的PAMs制备SAGE文库。每个SAGE文库测序至少95,000个标签。
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by SAGE、Sus scrofa。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-10346
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数据说明
E-GEOD-10346 猪肺泡巨噬细胞PRRSV感染的SAGE转录谱分析 家猪 本研究的目的是对正常猪肺泡巨噬细胞(PAMs)感染PRRSV后发生的基因表达变化进行深入、全面的分析。目的
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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