溶血性葡萄球菌JCSC 1435菌株蛋白质组数据库
该数据集为溶血性葡萄球菌JCSC 1435菌株的蛋白质组数据库,通过解析从UniProt下载的注释蛋白质组构建而成。数据涵盖每种蛋白质的名称、氨基酸序列、残基数量、分子量及核苷酸序列,可用于功能基因组学工作流,帮助识别与该菌致病性相关的基因

基本信息
资源简介
溶血性葡萄球菌JCSC 1435菌株蛋白质组数据库
Proteome database of Staphylococcus haemolyticus strain JCSC 1435
该数据集为溶血性葡萄球菌JCSC 1435菌株的蛋白质组数据库,通过解析从UniProt下载的注释蛋白质组构建而成。数据涵盖每种蛋白质的名称、氨基酸序列、残基数量、分子量及核苷酸序列,可用于功能基因组学工作流,帮助识别与该菌致病性相关的基因。该菌为革兰氏阳性机会致病菌,可耐受多种抗生素,并能形成生物膜,在从皮肤正常栖息地移位时导致治疗困难的机会性感染(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):溶血性葡萄球菌是一种革兰氏阳性机会致病菌,能够耐受多种抗生素。更重要的是,形成生物膜的能力使该菌成为机会性感染治疗中特别困难的目标,尤其是在溶血性葡萄球菌从其正常栖息地皮肤移位的情况下。本工作通过解析从UniProt下载的注释蛋白质组,呈现了溶血性葡萄球菌JCSC 1435菌株的蛋白质组数据库。该资源包含蛋白质组中每种蛋白质的蛋白质名称、氨基酸序列、残基数量、分子量和核苷酸序列,应在旨在识别该菌致病基因的功能基因组学工作流中找到用途。
【主题与分类】
主题标签:number of residues、proteome database、Staphylococcus haemolyticus、Medicine, Health and Life Sciences、molecular weight、protein name。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Afa94062ca081fdcf39e4a54fff206a29bbcbbb65544037430fad963b4b3b1fca
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
溶血性葡萄球菌是一种革兰氏阳性机会致病菌,能够耐受多种抗生素。更重要的是,其形成生物膜的能力使该菌成为机会性感染治疗中尤为棘手的目标,尤其是在溶血性葡萄球菌从其正常栖息地——皮肤——移位的情况下。本研究通过解析从UniProt下载的溶血性葡萄球菌菌株JCSC 1435的注释蛋白质组,呈现了该菌株的蛋白质组数据库。该资源包含蛋白质组中每种蛋白质的蛋白质名称、氨基酸序列、残基数、分子量及核苷酸序列,有望在旨在鉴定该菌致病相关基因的功能基因组学工作流程中得到应用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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