Jurkat与HEK293T细胞中宿主因子LEDGF/p75和CPSF6扰动下的HIV-1整合位点处理数据集
该数据集包含来自Jurkat和HEK293T细胞的HIV-1整合位点处理后BED文件，覆盖野生型病毒在野生型细胞以及LEDGF/p75、CPSF6或两者同时缺陷细胞中的整合情况，每个条件的生物学重复整合位点已合并
基本信息
资源简介
Jurkat与HEK293T细胞中宿主因子LEDGF/p75和CPSF6扰动下的HIV-1整合位点处理数据集
Processed HIV-1 integration site datasets from Jurkat and HEK293T cells with host factors (LEDGF/p75 and CPSF6) perturbations
该数据集包含来自Jurkat和HEK293T细胞的HIV-1整合位点处理后BED文件，覆盖野生型病毒在野生型细胞以及LEDGF/p75、CPSF6或两者同时缺陷细胞中的整合情况，每个条件的生物学重复整合位点已合并。数据可用于研究宿主因子LEDGF/p75和CPSF6对HIV-1整合位点分布的影响，支持感染性疾病相关的整合位点分析（来源 DataONE）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含来自Jurkat和HEK293T细胞的HIV-1整合位点处理后BED文件，涵盖野生型HIV-1病毒在WT细胞以及LEDGF/p75、CPSF6或这两种宿主因子均缺陷的细胞中的情况。每个条件的生物学重复整合位点已合并。
【主题与分类】
主题标签：Medicine, Health and Life Sciences。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ab67f26cdb152ddb5b523df1a2914c9351614b6f413a75f1958a8ba2f46f29e2a
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集包含经处理的 BED 文件，这些文件记录了 HIV-1 整合位点，由 Jurkat 和 HEK293T 细胞生成，涵盖野生型 HIV-1 病毒在 WT 细胞以及缺乏 LEDGF/p75、CPSF6 或同时缺乏这两种宿主因子的细胞中的情况。每种条件下，来自生物学重复的整合位点均已合并。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
