PRJNA434794：犬类皮肤微生物群、环境与过敏之间的关联
采用犬类模型，在城市和乡村环境中考察了皮肤微生物群、环境微生物暴露与过敏患病率之间的关联。皮肤微生物群通过细菌 16S rRNA 基因序列进行表征
基本信息
资源简介
PRJNA434794：犬类皮肤微生物群、环境与过敏之间的关联
PRJNA434794 数据集围绕犬类皮肤微生物群、环境微生物暴露与过敏患病率之间的关联展开，研究同时覆盖城市与乡村两类环境，以犬作为模型动物。数据集的核心内容是对皮肤微生物群进行细菌 16S rRNA 基因序列表征，并结合问卷调查所量化的犬主人生活方式与犬的过敏症状，从多个维度刻画皮肤暴露于环境微生物的状况。该数据集在来源站点的分类中归入感染性疾病 / 其他类别，来源站为 ebi.ac.uk，适合关注皮肤微生物生态、环境暴露与过敏关联的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究关注皮肤微生物群与过敏患病率之间的关系，并特别将环境微生物暴露纳入考察范围。研究选择犬作为模型，在城市和乡村两种环境中同时开展观察，试图从生活环境与生活方式的角度理解过敏发生的相关因素。皮肤微生物群通过细菌 16S rRNA 基因序列进行表征，这为在序列层面描述皮肤微生物组成提供了基础。研究还通过一份大型问卷对犬主人的生活方式以及犬的过敏症状进行量化，使环境暴露与健康结局能够在同一框架下被记录和分析。
【数据内容】
数据集包含的核心信息涉及三个方面的皮肤环境微生物暴露描述：其一为出生环境与当前住所所在居住环境的土地利用情况；其二为犬在运动过程中与不同土地利用类型的接触；其三为犬主人的生活方式。与此同时，犬的过敏症状以及主人生活方式通过大型问卷进行量化记录。皮肤微生物群方面的数据以细菌 16S rRNA 基因序列的形式呈现，用于表征皮肤微生物群。关于数据的具体样本数量、序列条数、问卷条目数、变量编码方式以及文件组织格式，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，数据集英文名称为“PRJNA434794: Associations between canine skin microbiota, environment and allergies”。研究在 urban 与 rural 环境中开展，以犬为模型考察皮肤微生物群、环境微生物暴露与过敏患病率之间的关联。皮肤微生物群通过细菌 16S rRNA 基因序列进行表征；环境微生物暴露通过土地利用、运动中的土地类型接触以及犬主人生活方式三方面加以描述；生活方式与过敏症状则通过大型问卷量化。关于采样时间、采样部位、测序平台、问卷发放与回收的具体流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于探讨皮肤微生物群组成与环境微生物暴露之间的关系，也可用于分析城市与乡村环境下过敏患病率差异的相关因素。由于同时包含土地利用、运动接触类型与主人生活方式等多维暴露信息，适合用于环境暴露与皮肤微生物生态的关联研究，以及以犬为模型的过敏相关研究。对于关注 16S rRNA 基因序列在皮肤微生物表征中应用的研究者，该数据集也可作为方法学参考。关于该数据集是否适用于其他物种或其他疾病终点，源站未提供。
【使用方法】
使用时可围绕皮肤微生物群的 16S rRNA 基因序列信息，结合出生环境与当前住所的土地利用、运动过程中接触的土地利用类型以及犬主人生活方式等暴露描述，并关联问卷量化的过敏症状与生活方式信息开展分析。具体的数据下载方式、文件命名规则、序列数据处理流程与分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以犬为模型，研究结论向其他物种外推时需谨慎。皮肤微生物群仅以细菌 16S rRNA 基因序列表征，关于其他微生物类群的信息源站未提供。环境暴露与过敏症状依赖问卷量化，问卷的具体设计、信效度以及缺失情况源站未提供。样本量、测序深度、批次效应等质量相关指标源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可条款源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA434794
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究采用犬类模型，在城市和乡村环境中考察了皮肤微生物群、环境微生物暴露与过敏患病率之间的关联。皮肤微生物群通过细菌16S rRNA基因序列进行表征。描述皮肤暴露于环境微生物的因素有三个：1）出生环境及当前住所居住环境中的土地利用情况，2）运动过程中与不同土地利用类型的接触，3）犬主人的生活方式。生活方式和过敏症状通过一份大型问卷进行量化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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