成人痤疮面部皮肤菌群16S rRNA基因测序

本项目包含一项为期8周的随机平行组研究中的面部皮肤菌群16S rRNA基因扩增子测序数据,研究对象为轻度至中度面部痤疮成人

ena
浏览 11
基因组分类面部皮肤菌群痤疮随机对照研究V4区测序感染性疾病
PRJNA1514939: 16S rRNA gene sequencing of facial skin microbiota in adults with acne following Matrinium Salicylate skincare regimens

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-14

资源简介

成人痤疮面部皮肤菌群16S rRNA基因测序

本项目收录了与面部痤疮成人皮肤菌群相关的16S rRNA基因扩增子测序数据,来源于一项为期8周的随机、平行组研究。研究对象为轻度至中度面部痤疮成人,参与者分别接受三种含Matrinium Salicylate的护肤方案中的一种。研究在基线、第4周和第8周采集面部皮肤样本,用于刻画皮肤细菌群落随时间的变化。测序针对细菌16S rRNA基因的V4区域开展,以支持微生物组分析。该数据集有助于从皮肤微生物群落层面观察痤疮相关护肤干预过程中的菌群动态,属于感染性疾病/其他分类下的公开数据资源。

【数据集背景】

该数据集对应的项目聚焦于成人面部痤疮与皮肤微生物群落之间的关系。痤疮是一种常见的毛囊皮脂腺单位慢性炎症性疾病,其发生发展与皮肤微生物群落结构变化密切相关。本项目通过一项为期8周的随机、平行组研究,纳入轻度至中度面部痤疮成人,并设置三种含Matrinium Salicylate的护肤方案,旨在借助16S rRNA基因扩增子测序,观察面部皮肤细菌群落在干预过程中的时间性变化。研究设计包含基线、第4周和第8周三个采样时间点,为纵向比较提供了样本基础。该数据集的分类归属为感染性疾病/其他,来源站为ebi.ac.uk。

【数据内容】

本数据集包含16S rRNA基因扩增子测序数据,测序对象为面部皮肤微生物群落。具体而言,测序针对细菌16S rRNA基因的V4区域,用于微生物组分析。样本来自一项8周随机、平行组研究中轻度至中度面部痤疮成人的面部皮肤。采样时间点包括基线、第4周和第8周,用以表征皮肤细菌群落的时间变化。参与者接受了三种含Matrinium Salicylate的护肤方案之一。除上述信息外,源站未提供关于数据文件类型、样本数量、序列数量、数据量大小等更详细的描述。

【采集与来源】

样本采集自轻度至中度面部痤疮成人的面部皮肤。研究为8周随机、平行组设计,参与者被分配至三种含Matrinium Salicylate的护肤方案中的一种。面部皮肤样本在基线、第4周和第8周三个时间点采集。测序工作针对细菌16S rRNA基因的V4区域进行,以获取用于微生物组分析的扩增子数据。数据来源站为ebi.ac.uk。关于样本采集的具体部位、采集方法、保存条件、伦理审批信息以及研究实施地点等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于皮肤微生物组研究,尤其是与面部痤疮相关的细菌群落分析。由于包含基线、第4周和第8周三个时间点的纵向样本,可用于观察含Matrinium Salicylate护肤方案干预过程中皮肤细菌群落的时间变化。其16S rRNA基因V4区域扩增子测序数据可用于微生物群落组成、多样性及相对丰度变化等分析。该数据集也可作为感染性疾病/其他分类下皮肤菌群相关研究的参考数据。关于该数据集是否适用于其他特定分析目的,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集为16S rRNA基因扩增子测序数据,通常可用于微生物组生物信息学分析流程,包括序列质量控制、扩增子序列变异或操作分类单元聚类、物种注释、多样性分析以及群落组成比较等。由于研究设计包含三个采样时间点和三种护肤方案,分析时可考虑按时间点和方案分组进行比较,以观察皮肤细菌群落的变化趋势。具体使用时应结合源站提供的项目信息与数据文件进行。关于数据下载方式、文件格式、分析软件推荐或处理参数等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于一项8周随机、平行组研究,样本采集时间点明确,测序目标区域为细菌16S rRNA基因V4区域。然而,源站未提供关于测序深度、序列质量、样本量、缺失数据、批次效应、对照设置或统计功效等方面的具体信息。由于仅针对16S rRNA基因V4区域进行扩增子测序,其分辨率通常限于细菌群落层面,对真菌、病毒或其他微生物类群以及功能基因信息的覆盖有限。该研究针对轻度至中度面部痤疮成人,结果外推至其他人群或其他皮肤状态时需谨慎。关于数据的具体质量指标和限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为ebi.ac.uk,项目英文名称为PRJNA1514939: 16S rRNA gene sequencing of facial skin microbiota in adults with acne following Matrinium Salicylate skincare regimens。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或数据共享政策,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1514939

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含一项为期8周、随机、平行组研究的面部皮肤微生物群16S rRNA基因扩增子测序数据,研究对象为轻至中度面部痤疮成人。参与者接受三种含Matrinium Salicylate的护肤方案之一。在基线、第4周和第8周采集面部皮肤样本,以表征皮肤细菌群落的时间变化。对细菌16S rRNA基因V4区进行测序,用于微生物组分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案