中国浙江省人临床沙门氏菌感染的基因组流行病学

数据围绕该单一研究计划汇集多种类型的生物学数据,并提供统一入口以链接项目产生的各类数据。该数据可用于沙门氏菌感染的基因组流行病学分析,例如菌株基因组测序与组装相关研究,具体样本数量、测序平台、分析方法及结论源站未提供(来源 NCBI)

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基因组分类Genome sequencing and assembly
PRJNA1482331: Genomic epidemiology of human clinical Salmonella enterica infections in Zhejiang Province, China

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

中国浙江省人临床沙门氏菌感染的基因组流行病学

PRJNA1482331 是一个围绕人类临床沙门氏菌感染开展基因组流行病学研究的生物项目,其英文全称为 Genomic epidemiology of human clinical Salmonella enterica infections in Zhejiang Province, China。该项目在 NCBI BioProject 数据库中的标识为 1482331,主题标签为“Genome sequencing and assembly”,本站将其归类于感染性疾病 / 其他。作为一个 BioProject,它并非单一的数据文件,而是将同一项研究计划所产生的多种类型生物学数据汇集在一起,并为用户提供统一入口,以便链接和检索该项目下生成的各类数据。该数据集可用于沙门氏菌感染的基因组流行病学分析,例如菌株基因组测序与组装相关研究,但关于具体样本数量、测序平台、分析方法及研究结论,源站未提供。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,源站标题为“Salmonella enterica (ID 1482331) - BioProject - NCBI”。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式,用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据,这些数据可以来自单一机构,也可以来自一个联合体。一个 BioProject 记录为用户提供了一个统一的位置,用以查找该项目所产生的不同类型的数据。本项目聚焦于中国浙江省人类临床沙门氏菌感染的基因组流行病学,属于感染性疾病相关研究范畴,主题标签为“Genome sequencing and assembly”。关于该研究计划的具体发起机构、参与单位、项目起止时间及资助信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集围绕“人类临床沙门氏菌感染的基因组流行病学”这一单一研究计划,汇集多种类型的生物学数据,并通过统一入口链接项目产生的各类数据。其主题标签表明数据涉及基因组测序与组装。就可用方向而言,该数据可用于沙门氏菌感染的基因组流行病学分析,例如菌株基因组测序与组装相关研究。关于项目内具体包含哪些数据文件、样本数量、测序平台、组装软件、分析方法及研究结论,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,在 NCBI BioProject 数据库中的记录标识为 1482331。项目英文名称显示其研究对象为中国浙江省的人类临床沙门氏菌感染。关于样本采集地点、采集时间、纳入标准、临床信息来源、测序机构及数据提交者等具体采集与来源信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于沙门氏菌感染的基因组流行病学分析,尤其是与菌株基因组测序和组装相关的研究场景。作为 BioProject 记录,它也可用于在 NCBI 体系内定位和链接该项目所产生的多种类型数据,便于研究者按项目维度获取数据资源。关于该数据是否适用于特定分析流程、能否用于临床诊断或公共卫生决策,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问标识为 1482331 的项目记录,并借助该记录提供的统一入口查找和链接项目产生的各类数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置及操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 形式组织,提供项目级的数据汇集与链接入口。关于数据质量评估、完整性、准确性、样本代表性及使用限制等信息,源站未提供。具体样本数量、测序平台、分析方法及结论亦未提供,因此无法对数据规模和技术特征作出进一步说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制及数据共享政策,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1482331

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该BioProject包含2018年至2025年间在中国浙江省系统收集的沙门氏菌分离株的全基因组测序数据。这些分离株来自临床病例以及浙江省疾病预防控制中心通过食源性疾病暴发监测系统(FDOSS)开展的常规公共卫生监测。该综合数据集旨在表征浙江省沙门氏菌的基因组流行病学、抗菌药物耐药性特征及时空传播动态。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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