苯氧乙醇对IA1和II型痤疮丙酸杆菌(ATCC 6919和CCSM 0331)的抗菌活性
主题标签:感染性疾病、苯氧乙醇、抗菌活性、转录组学、phylotype IA1、phylotype II。本数据集为感染性疾病领域公开数据集,主题涵盖感染性疾病。

基本信息
资源简介
苯氧乙醇对IA1和II型痤疮丙酸杆菌(ATCC 6919和CCSM 0331)的抗菌活性
PRJNA1178848 数据集聚焦于苯氧乙醇对两种不同系统发育群的痤疮皮肤杆菌(Cutibacterium acnes)的抗菌活性研究,具体对象为 ATCC 6919(phylotype IA1)与 CCSM 0331(phylotype II)。该数据集通过转录组学手段,探索苯氧乙醇对这两株分属不同系统发育群的细菌的抑制机制差异。作为感染性疾病领域的公开数据集,其主题标签涵盖感染性疾病、苯氧乙醇、抗菌活性、转录组学、phylotype IA1 与 phylotype II,来源站为 ebi.ac.uk。整体而言,该数据集为理解苯氧乙醇这一常用抗菌成分在痤疮皮肤杆菌不同系统发育群中的作用差异提供了转录组层面的研究材料,有助于感染性疾病相关的基础与应用研究。
【数据集背景】
痤疮皮肤杆菌(Cutibacterium acnes)是一种与人类皮肤相关的细菌,存在不同的系统发育群(phylotype),其中 phylotype IA1 和 phylotype II 是两种具有代表性的类群。苯氧乙醇是一种具有抗菌活性的化合物,常被用于抑制微生物生长。然而,苯氧乙醇对分属不同系统发育群的痤疮皮肤杆菌的抑制机制是否存在差异,尚需深入研究。该数据集正是围绕这一问题,以 ATCC 6919(代表 phylotype IA1)和 CCSM 0331(代表 phylotype II)为研究对象,通过转录组学方法比较苯氧乙醇对两株细菌的抑制机制差异。这一背景使得该数据集在感染性疾病领域,尤其是针对皮肤相关细菌的抗菌机制研究中具有明确的问题导向。
【数据内容】
该数据集的核心内容为转录组学数据,用于研究苯氧乙醇对痤疮皮肤杆菌 ATCC 6919(phylotype IA1)和 CCSM 0331(phylotype II)的抑制机制差异。数据涉及两种不同系统发育群的细菌在苯氧乙醇作用下的转录组响应,旨在揭示二者在抑制机制上的异同。数据集的主题标签包括感染性疾病、苯氧乙醇、抗菌活性、转录组学、phylotype IA1 和 phylotype II,这些标签概括了数据所涵盖的抗菌活性与转录组学分析维度。关于数据的具体样本数量、测序深度、基因表达矩阵、差异表达基因列表等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。根据源站描述,研究通过转录组学手段,探讨苯氧乙醇对痤疮皮肤杆菌 ATCC 6919(IA1)和 CCSM 0331(II)这两种不同系统发育群的抑制机制差异。数据集英文名称为“PRJNA1178848: The antimicrobial activity of phenoxyethanol against phylotype IA1 and II Cutibacterium acnes (ATCC 6919 and CCSM 0331)”。关于样本采集的具体时间、地点、实验条件、测序平台、建库方法等采集与来源细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于感染性疾病领域的研究,特别是针对痤疮皮肤杆菌的抗菌机制探索。具体而言,可用于分析苯氧乙醇对 phylotype IA1 与 phylotype II 两种不同系统发育群痤疮皮肤杆菌的转录组响应差异,进而理解其抑制机制的区别。此外,该数据集也可为抗菌活性相关研究、转录组学比较分析以及皮肤微生物感染相关的基础研究提供参考。由于主题标签涵盖感染性疾病,其潜在应用场景还包括与苯氧乙醇抗菌作用相关的机制研究。关于更具体的适用场景,如药物开发、临床转化等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk。使用者可依据来源站提供的访问方式获取数据。关于数据的具体使用方式,例如如何下载、如何处理转录组数据、是否需要特定分析工具或流程等,源站未提供。建议使用者参考来源站的相关说明进行数据获取与分析。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,属于公开数据集。其研究内容基于转录组学方法,针对苯氧乙醇对两株不同系统发育群痤疮皮肤杆菌的抑制机制差异。关于数据的质量控制指标、样本量、重复数、测序质量、潜在偏差等质量与限制信息,源站未提供。使用者在使用时应注意结合来源站的最新说明进行评估。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用方式、许可协议、使用条款等信息,源站未提供。使用者应遵循来源站的相关规定进行引用与使用。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1178848
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过转录组学研究了苯氧乙醇对痤疮丙酸杆菌ATCC 6919 (IA1)和痤疮丙酸杆菌CCSM 0331 (II)这两个不同系统发育群的抑制机制差异。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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