孟加拉国人类细小病毒4基因组学研究

源站标题显示其内容为人类细小病毒4的基因组表征,属于感染性疾病领域的其他类数据。BioProject 记录汇集了由单一机构或联盟发起的同一研究计划所产生的多种生物数据,并提供统一入口以链接该项目生成的不同数据类型

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基因组Other
PRJEB88738: PARV4 genomics in Bangladesh

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

孟加拉国人类细小病毒4基因组学研究

PRJEB88738 是一个以“PARV4 genomics in Bangladesh”为英文名称的生物项目数据集,其源站标题指向人类细小病毒4(Human Parvovirus 4)的基因组表征研究,编号为 1505458,收录于 NCBI 的 BioProject 数据库。该数据集在本站被归类为“感染性疾病 / 其他”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从整体定位看,它属于感染性疾病领域中以基因组数据为核心的生物项目记录,主题标签为“Other”。BioProject 作为生物数据的集合形式,通常围绕单一研究计划组织,由单一机构或联盟发起,并为用户提供统一入口,以链接该项目所生成的不同数据类型。因此,该数据集的核心价值在于汇集与人类细小病毒4基因组表征相关的多种生物数据,并通过统一记录形式提供访问路径,便于研究者定位和获取该研究计划产生的数据资源。

【数据集背景】

该数据集对应的研究计划聚焦于孟加拉国(Bangladesh)境内人类细小病毒4的基因组表征。源站标题明确显示其内容为人类细小病毒4的基因组表征,属于感染性疾病领域的其他类数据。BioProject 记录的设计目的,是汇集由单一机构或联盟发起的同一研究计划所产生的多种生物数据,并提供统一入口以链接该项目生成的不同数据类型。因此,该数据集的背景可理解为:围绕孟加拉国人类细小病毒4这一特定研究对象,形成的一个生物项目记录,用于组织、关联和呈现该研究计划下产生的基因组及相关生物数据。关于该研究计划的具体发起机构、联盟组成、项目周期、资助来源等更细化的背景信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的内容围绕人类细小病毒4的基因组表征展开。源站标题显示其内容为人类细小病毒4的基因组表征,主题标签为“Other”。作为 BioProject 记录,它汇集的是与单一研究计划相关的多种生物数据类型,而非仅限单一类型的数据。BioProject 记录本身提供统一入口,使用户能够找到并链接到该项目生成的不同数据类型。因此,该数据集在内容层面表现为一个项目级的容器或索引,指向与孟加拉国人类细小病毒4基因组表征相关的数据集合。关于具体包含哪些样本、序列、组装结果、注释信息或实验数据,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI 的 BioProject 数据库。其英文名称为 PRJEB88738: PARV4 genomics in Bangladesh,源站标题为“Genomic Characterization of Human Parvovirus 4 in ... (ID 1505458) - BioProject - NCBI”。从来源属性看,它属于 BioProject 记录,而 BioProject 是生物数据的集合,来源于单一机构或联盟发起的单一研究计划。该数据集在本站被归类为“感染性疾病 / 其他”。关于样本采集地点、采集时间、采集方法、伦理审批、数据提交机构等具体采集与来源细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要定位和访问人类细小病毒4基因组表征相关生物数据的场景。由于 BioProject 记录提供统一入口以链接同一研究计划生成的不同数据类型,研究者可将其作为查找该项目相关数据的起点。其主题标签为“Other”,本站分类为“感染性疾病 / 其他”,因此适用于感染性疾病领域中与人类细小病毒4基因组表征相关的数据检索、数据关联和数据获取等用途。对于需要了解孟加拉国地区人类细小病毒4基因组研究数据资源的用户,该记录可提供项目级的入口信息。关于该数据集在具体研究分析、临床诊断、公共卫生决策或疫苗开发等场景中的直接应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式存在,用户可通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问。其源站标题包含 ID 1505458,英文名称为 PRJEB88738: PARV4 genomics in Bangladesh。BioProject 记录提供统一入口,使用户能够找到链接到该项目生成的不同数据类型。因此,使用方法上,用户可先通过该 BioProject 记录定位项目,再经由记录中的链接关系访问其关联的多种生物数据。关于具体的下载方式、数据格式、访问权限、API 接口或分析工具等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录,其质量与限制取决于源站 NCBI BioProject 数据库的管理与维护。BioProject 作为生物数据的集合,来源于单一机构或联盟发起的单一研究计划,并提供统一入口以链接不同数据类型。该数据集的主题标签为“Other”,本站分类为“感染性疾病 / 其他”。关于数据完整性、准确性、覆盖度、更新频率、版本控制、样本代表性或潜在偏倚等质量与限制方面的具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Genomic Characterization of Human Parvovirus 4 in ... (ID 1505458) - BioProject - NCBI”,英文名称为 PRJEB88738: PARV4 genomics in Bangladesh。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策或版权归属等具体信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB88738

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类细小病毒4(PARV4)属于四细小病毒属,在临床场景中的检出日益增多,但其流行病学、传播动力学和基因组多样性在低收入和中等收入国家仍研究不足。本研究作为正在进行的传染病监测工作的一部分,调查了PARV4在孟加拉国的存在情况及遗传多样性。采用分子方法对样本进行筛查,阳性病例则进行基因组测序和分析。所生成的数据有助于更广泛地理解PARV4的进化、分布及其在不同临床和人口学背景下的潜在相关性。本提交内容属于一个不断扩展的基因组数据集,旨在为全球理解PARV4提供信息。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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