太平洋牡蛎对温度胁迫的转录组响应（30C，自由摄食），温度胁迫样本，DECICOMP项目
该数据集来自 NCBI，研究太平洋牡蛎（Magallana gigas）在 30C 自由摄食条件下温度胁迫后的转录组响应，属于 DECICOMP 项目
基本信息
资源简介
太平洋牡蛎对温度胁迫的转录组响应（30C，自由摄食），温度胁迫样本，DECICOMP项目
该数据集来自 NCBI，研究太平洋牡蛎（Magallana gigas）在 30C 自由摄食条件下温度胁迫后的转录组响应，属于 DECICOMP 项目。实验使用两个 3 月龄易感双亲家系（F11N 和 F14R），在非允许条件下驯化 16 天，随后通过共居感染 72 小时，并在 0h、3h、6h、12h、24h、48h、72h 采样，每个样本为 10 只牡蛎的混池，设三个重复。RNA-Seq 在 Illumina NextSeq 550 平台完成，可用于分析高温胁迫下牡蛎在 POMS 感染过程中的分子响应（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：太平洋牡蛎（Magallana gigas）对温度波动高度敏感，而温度波动可影响其对太平洋牡蛎死亡综合征（POMS）的响应。本研究将两个 3 月龄、来自双亲牡蛎的疾病易感家系（F11N 和 F14R）置于非允许条件（30C，自由摄食）下。该驯化持续 16 天，随后通过共居感染 72 小时，并在 0h、3h、6h、12h、24h、48h 和 72h 采样，每个样本为 10 只牡蛎的混池，设三个重复。使用 Illumina NextSeq 550 平台进行 RNA-Seq，以研究温度诱导的转录变化。所得数据集为理解牡蛎在 POMS 感染期间对高温胁迫的分子响应提供了见解。
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86646
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86646
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
太平洋牡蛎（Magallana gigas）对温度波动高度敏感，而温度波动会影响其对太平洋牡蛎死亡综合征（POMS）的响应。本研究选取了两个家系（F11N和F14R）的3月龄双亲牡蛎，这些牡蛎对疾病易感，将其置于非许可条件（30°C，自由投喂）下。此 acclimatation 持续16天，随后通过共居感染72小时，并在0h、3h、6h、12h、24h、48h和72h进行采样。每个样本由10只牡蛎混合而成，设三个重复。使用Illumina NextSeq 550平台进行RNA-Seq，以探究温度诱导的转录变化。所得数据集为了解牡蛎在POMS感染期间对高温胁迫的分子响应提供了见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
