太平洋牡蛎温度胁迫下微生物组变化(30℃,自由摄食)16S rRNA宏条形码温度胁迫样本
该数据集来自 NCBI,包含太平洋牡蛎(Magallana gigas)在 30C 高温、自由摄食条件下两个家系(F11N 和 F14R)的 16S rRNA 宏条形码测序数据

基本信息
资源简介
太平洋牡蛎温度胁迫下微生物组变化(30℃,自由摄食)16S rRNA宏条形码温度胁迫样本
该数据集来自 NCBI,包含太平洋牡蛎(Magallana gigas)在 30C 高温、自由摄食条件下两个家系(F11N 和 F14R)的 16S rRNA 宏条形码测序数据。样本在共居感染后 0h、3h、6h、12h、24h、48h、72h 采集,每个样本为 10 只牡蛎的混池,设三个重复。DNA 提取后对 V3-V4 区进行 Illumina MiSeq 2x250 bp 测序。数据可用于研究高温条件下牡蛎微生物组的变化及其与疾病易感性的关联(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):高温可显著改变太平洋牡蛎(Magallana gigas)的微生物组组成,影响疾病易感性。本研究调查了两个家系(F11N 和 F14R)的 3 月龄疾病易感双亲牡蛎在非允许条件(30C,自由摄食)下维持的微生物群落。该驯化持续 16 天,随后通过共居感染 72 小时,并在 0h、3h、6h、12h、24h、48h 和 72h 采样。每个样本为 10 只牡蛎的混池,设三个重复。提取 DNA,并使用 Illumina MiSeq 平台(2x250 bp)进行 16S rRNA 宏条形码测序(V3-V4 区)。该数据集可用于研究高温条件下的微生物组变化。
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86594
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- OpenDataLab:
数据说明
升高的温度可显著改变太平洋牡蛎(Magallana gigas)的微生物组组成,从而影响疾病易感性。本研究调查了两个家系(F11N和F14R)的3月龄双亲牡蛎后代中易感疾病个体的微生物群落,这些牡蛎维持在不允许感染条件下(30°C,自由摄食)。该适应过程持续16天,随后通过共居感染72小时,并在0小时、3小时、6小时、12小时、24小时、48小时和72小时进行采样。每个样本为10只牡蛎的混合样本,设三个重复。提取DNA后,使用Illumina MiSeq平台(2×250 bp)进行16S rRNA宏条形码测序(V3-V4区域)。该数据集可用于研究高温条件下的微生物组变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




