DECICOMP项目:太平洋牡蛎在对照条件(23C,自由摄食)下的转录组图谱,对照样本
该数据集为DECICOMP项目下太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23°C、自由摄食)下的转录组数据,包含两个易感双亲家系(F11N和F14R)的3月龄牡蛎,经16天适应后采样,每个样本为10只牡蛎的混样、三个重复,使用Illumina NextSeq 550进行RNA-Seq

基本信息
资源简介
DECICOMP项目:太平洋牡蛎在对照条件(23C,自由摄食)下的转录组图谱,对照样本
该数据集为DECICOMP项目下太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23°C、自由摄食)下的转录组数据,包含两个易感双亲家系(F11N和F14R)的3月龄牡蛎,经16天适应后采样,每个样本为10只牡蛎的混样、三个重复,使用Illumina NextSeq 550进行RNA-Seq。数据覆盖未受胁迫牡蛎的基因表达模式,可作为后续比较研究的对照参考,用于探究温度、饮食和年龄对疾病易感性的分子机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):太平洋牡蛎(Magallana gigas)因太平洋牡蛎死亡综合征(POMS)而经历大量死亡。DECICOMP项目通过评估温度、饮食和年龄的影响,研究疾病允许性背后的分子机制。在本研究中,两个家系(F11N和F14R)的3月龄疾病易感双亲牡蛎被维持在允许条件下(23C,自由摄食)。该适应过程持续16天,随后通过共居感染72小时,并在0h、3h、6h、12h、24h、48h和72h采样,每个样本是10只牡蛎的混样,有三个重复。使用Illumina NextSeq 550平台对提取的总RNA进行RNA-Seq。所得数据集提供了对未受胁迫牡蛎中基因表达模式的见解,并可作为进一步比较研究的对照参考。
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86525
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- OpenDataLab:
数据说明
太平洋牡蛎(Magallana gigas)因太平洋牡蛎死亡综合征(POMS)而遭受重大死亡。DECICOMP项目通过评估温度、饮食和年龄的影响,研究疾病容许性背后的分子机制。本研究将两个家系(F11N和F14R)的3月龄疾病易感双亲牡蛎维持在容许条件下(23°C,自由摄食)。此驯化持续16天,随后通过共居感染72小时,并在0小时、3小时、6小时、12小时、24小时、48小时和72小时采样。每个样本为10只牡蛎的混合样本,设三个重复。使用Illumina NextSeq 550平台对提取的总RNA进行RNA-Seq。所得数据集为了解未受胁迫牡蛎中的基因表达模式提供了见解,并可作为进一步比较研究的对照参考。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




