DECICOMP项目:太平洋牡蛎在对照条件(23C,自由摄食)下的转录组图谱,对照样本

该数据集为DECICOMP项目下太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23°C、自由摄食)下的转录组数据,包含两个易感双亲家系(F11N和F14R)的3月龄牡蛎,经16天适应后采样,每个样本为10只牡蛎的混样、三个重复,使用Illumina NextSeq 550进行RNA-Seq

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基因组分类Other
PRJEB86525: Transcriptomic profiling of Pacific oysters (Magallana gigas) under control conditions (23C, fed ad libitum), control samples, DECICOMP project

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

DECICOMP项目:太平洋牡蛎在对照条件(23C,自由摄食)下的转录组图谱,对照样本

该数据集为DECICOMP项目下太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23°C、自由摄食)下的转录组数据,包含两个易感双亲家系(F11N和F14R)的3月龄牡蛎,经16天适应后采样,每个样本为10只牡蛎的混样、三个重复,使用Illumina NextSeq 550进行RNA-Seq。数据覆盖未受胁迫牡蛎的基因表达模式,可作为后续比较研究的对照参考,用于探究温度、饮食和年龄对疾病易感性的分子机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):太平洋牡蛎(Magallana gigas)因太平洋牡蛎死亡综合征(POMS)而经历大量死亡。DECICOMP项目通过评估温度、饮食和年龄的影响,研究疾病允许性背后的分子机制。在本研究中,两个家系(F11N和F14R)的3月龄疾病易感双亲牡蛎被维持在允许条件下(23C,自由摄食)。该适应过程持续16天,随后通过共居感染72小时,并在0h、3h、6h、12h、24h、48h和72h采样,每个样本是10只牡蛎的混样,有三个重复。使用Illumina NextSeq 550平台对提取的总RNA进行RNA-Seq。所得数据集提供了对未受胁迫牡蛎中基因表达模式的见解,并可作为进一步比较研究的对照参考。

【主题与分类】

主题标签:Other。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86525

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

太平洋牡蛎(Magallana gigas)因太平洋牡蛎死亡综合征(POMS)而遭受重大死亡。DECICOMP项目通过评估温度、饮食和年龄的影响,研究疾病容许性背后的分子机制。本研究将两个家系(F11N和F14R)的3月龄疾病易感双亲牡蛎维持在容许条件下(23°C,自由摄食)。此驯化持续16天,随后通过共居感染72小时,并在0小时、3小时、6小时、12小时、24小时、48小时和72小时采样。每个样本为10只牡蛎的混合样本,设三个重复。使用Illumina NextSeq 550平台对提取的总RNA进行RNA-Seq。所得数据集为了解未受胁迫牡蛎中的基因表达模式提供了见解,并可作为进一步比较研究的对照参考。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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