太平洋牡蛎对照组微生物组组成16S rRNA宏条形码对照样本
该数据集来自 NCBI,为 DECICOMP 项目中太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23C、自由摄食)下的 16S rRNA 宏条形码对照样本

基本信息
资源简介
太平洋牡蛎对照组微生物组组成16S rRNA宏条形码对照样本
该数据集来自 NCBI,为 DECICOMP 项目中太平洋牡蛎(Magallana gigas)在对照条件(23C、自由摄食)下的 16S rRNA 宏条形码对照样本。研究涉及两个家系(F11N 和 F14R)的 3 月龄易感双亲牡蛎,经 16 天适应后通过共居感染 72 小时,并在 0h、3h、6h、12h、24h、48h、72h 采样,每个样本为 10 只牡蛎的混合池、三个重复,提取 DNA 后使用 Illumina MiSeq 平台(2x250 bp)对 V3-V4 区进行测序。数据可用于了解基线微生物群落,并作为与应激暴露牡蛎比较分析的参考(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):微生物组在太平洋牡蛎(Magallana gigas)的健康和抗病性中起着至关重要的作用。本研究调查了两个家系(F11N 和 F14R)的 3 月龄易感双亲牡蛎在允许条件(23C,自由摄食)下维持的微生物组成。适应持续 16 天,然后通过共居感染 72 小时,并在 0h、3h、6h、12h、24h、48h 和 72h 采样。每个样本是 10 只牡蛎的混合池,有三个重复。提取 DNA,并使用 Illumina MiSeq 平台(2x250 bp)进行 16S rRNA 宏条形码测序(V3-V4 区)。该数据集提供了对基线微生物群落的见解,并可作为与应激暴露牡蛎进行比较分析的参考。
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86519
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- OpenDataLab:
数据说明
微生物组在太平洋牡蛎(Magallana gigas)的健康与抗病性中起着至关重要的作用。本研究调查了两个家系(F11N和F14R)的3月龄易感病双亲牡蛎在适宜条件下(23°C,自由摄食)的微生物组成。适应期为16天,随后通过共居感染72小时,并在0h、3h、6h、12h、24h、48h和72h进行采样。每个样本为10只牡蛎的混合样本,设三个重复。提取DNA后,使用Illumina MiSeq平台(2x250 bp)进行16S rRNA宏条形码测序(V3-V4区域)。该数据集为了解基线微生物群落提供了见解,并可作为与应激暴露牡蛎进行比较分析的参考。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




