PRJEB22846：烧伤人伤口分离细菌
通过16SrRNA基因测序检测从烧伤人伤口分离的细菌，并检测coagulase基因等位基因。主题标签：感染性疾病、烧伤伤口、细菌分离、16SrRNA基因测序、coagulase基因等位基因
基本信息
资源简介
PRJEB22846：烧伤人伤口分离细菌
PRJEB22846 是一个以“Bacteria isolated from burns human wounds”（从人类烧伤伤口分离的细菌）为主题的细菌学研究数据集，收录于欧洲生物信息研究所（EBI）的数据资源中，在本站归入“感染性疾病 / 其他”分类。该数据集围绕烧伤创面细菌感染的检测展开，核心方法为 16SrRNA 基因测序，用于从烧伤患者伤口样本中检出并鉴定细菌分离株；同时，研究还涉及 coagulase（凝固酶）基因等位基因的检测。整体而言，该数据集服务于烧伤伤口感染相关的细菌鉴定与分子特征分析，适合关注创面感染病原学、细菌分子检测方法的研究人员参考使用。
【数据集背景】
烧伤患者的创面因皮肤屏障破坏而容易发生细菌定植与感染，病原菌的准确鉴定对感染防控和临床处置具有重要意义。该数据集来源于 ebi.ac.uk，其研究背景聚焦于从人类烧伤伤口中分离细菌，并借助分子生物学手段对分离株进行鉴定与特征分析。源站描述明确指出，相关工作通过 16SrRNA 基因测序检测烧伤人伤口中的细菌分离株，并检测 coagulase 基因等位基因，说明该数据集所对应的研究同时关注细菌种类的分子鉴定与特定毒力相关基因的等位基因型别。
【数据内容】
该数据集的内容围绕烧伤伤口来源的细菌分离株展开。依据源站描述，数据涉及的检测对象包括两类分子靶标：一是 16SrRNA 基因，用于细菌分离株的测序检测与鉴定；二是 coagulase 基因等位基因，用于检测该基因的不同等位基因型别。数据集的主题标签涵盖感染性疾病、烧伤伤口、细菌分离、16SrRNA 基因测序以及 coagulase 基因等位基因等方向。关于样本数量、分离株数目、测序数据量、基因序列条数等具体规模信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。样本来源为人类烧伤伤口，研究材料为从这些伤口中分离获得的细菌。检测手段包括 16SrRNA 基因测序和 coagulase 基因等位基因检测。关于样本采集的具体地点、时间跨度、纳入患者数量、伦理审批信息以及分离培养的具体流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可应用于烧伤创面感染相关的细菌鉴定研究，尤其是采用 16SrRNA 基因测序进行细菌分离株分子鉴定的场景；也可用于关注 coagulase 基因等位基因检测与分型的细菌分子特征研究。对于感染性疾病领域的病原学调查、烧伤伤口细菌分离株的分子检测方法参考等用途，该数据集具有潜在的参考价值。关于该数据集是否适用于临床诊断、流行病学统计或药物研发等具体下游应用，源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集可通过 ebi.ac.uk 获取，具体访问路径与下载方式以源站提供的信息为准。使用时可结合 16SrRNA 基因测序数据与 coagulase 基因等位基因检测结果，对烧伤伤口来源的细菌分离株进行鉴定与分子特征分析。关于数据文件格式、序列数据组织方式、配套元数据字段以及分析流程建议，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 16SrRNA 基因测序和 coagulase 基因等位基因检测，方法指向明确，但关于数据质量评估指标、测序深度、序列质量过滤标准、分离株鉴定置信度等信息，源站未提供。此外，样本量、覆盖人群范围以及数据完整性等限制性信息亦未在源站描述中体现，使用时应结合源站原始记录加以核实。
【引用与许可】
该数据集收录于 ebi.ac.uk，英文名称为“PRJEB22846: Bacteria isolated from burns human wounds”。关于具体的引用格式、文献出处、数据许可协议及使用条款，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB22846
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过16SrRNA基因测序检测烧伤人体伤口中的细菌分离株，并检测凝固酶基因等位基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
