尼泊尔2018–2024年伤寒与甲型副伤寒沙门菌全基因组测序数据集
数据可用于刻画尼泊尔伤寒沙门菌的基因组流行病学、抗菌药物耐药决定因素与传播动态，并支持在伤寒结合疫苗引入和COVID-19大流行背景下的相关研究（来源 ncb
基本信息
资源简介
尼泊尔2018–2024年伤寒与甲型副伤寒沙门菌全基因组测序数据集
该数据集包含2018至2024年尼泊尔肠道热监测中分离的350株Salmonella enterica serovar Typhi与114株serovar Paratyphi A的全基因组序列，样本来自经血培养确诊的患者，由Dhulikhel Hospital与Kathmandu University Hospital协调的医院前瞻性与回顾性监测收集。基因组DNA从细菌培养物提取，在Illumina NovaSeq X Plus平台测序，产生2 x 150 bp双端reads。数据可用于刻画尼泊尔伤寒沙门菌的基因组流行病学、抗菌药物耐药决定因素与传播动态，并支持在伤寒结合疫苗引入和COVID-19大流行背景下的相关研究（来源 ncb。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究包含2018年至2024年间从尼泊尔经血培养确诊肠道热的患者中收集的350株Salmonella enterica serovar Typhi和114株serovar Paratyphi A分离株的全基因组序列，这些样本通过由Dhulikhel Hospital、Kathmandu University Hospital协调的医院前瞻性与回顾性监测获得。基因组DNA从细菌培养物中提取，并在Illumina NovaSeq X Plus平台上测序，产生双端reads（2 x 150 bp）。该数据集旨在刻画尼泊尔伤寒沙门菌在伤寒结合疫苗引入和COVID-19大流行背景下的基因组流行病学、抗菌药物耐药决定因素及传播动态。
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB121301
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB121301
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究包含2018年至2024年间在尼泊尔从血培养确诊的肠热症患者中收集的350株肠道沙门菌伤寒血清型和114株副伤寒甲血清型分离株的全基因组序列，这些样本通过由杜利凯尔医院、加德满都大学医院协调的前瞻性和回顾性医院监测获得。基因组DNA从细菌培养物中提取，并在Illumina NovaSeq X Plus平台上进行测序，产生双端reads（2 x 150 bp）。该数据集旨在描述尼泊尔伤寒沙门菌在伤寒结合疫苗引入和COVID-19大流行背景下的基因组流行病学、抗菌药物耐药决定因素及传播动态。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
