寨卡病毒与模拟对照GLORI测序数据集
该数据集来自 NCBI，采用 GLORI-seq 技术对模拟感染与寨卡病毒（ZIKV）感染的人 Huh7 肝癌细胞在感染后 48 小时的 Poly(A) 富集 RNA 进行测序，每种条件设三个独立生物学重复
基本信息
资源简介
寨卡病毒与模拟对照GLORI测序数据集
该数据集来自 NCBI，采用 GLORI-seq 技术对模拟感染与寨卡病毒（ZIKV）感染的人 Huh7 肝癌细胞在感染后 48 小时的 Poly(A) 富集 RNA 进行测序，每种条件设三个独立生物学重复。数据可实现单核苷酸分辨率的 m6A 修饰位点识别与定量评估，用于研究感染相关的 RNA 甲基化变化，包括 m6A 沉积与可变多聚腺苷酸化、转录本结构及宿主抗病毒反应之间的关系（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究使用乙二醛和亚硝酸盐介导的未甲基化腺苷脱氨，随后进行 RNA 测序（GLORI-seq），以表征寨卡病毒（ZIKV）感染期间转录组范围的 N6-甲基腺苷（m6A）RNA 修饰动态。从感染后 48 小时的模拟感染和 ZIKV 感染的人 Huh7 肝癌细胞中分离 Poly(A) 富集 RNA，每种条件设三个独立生物学重复。GLORI-seq 能够以单核苷酸分辨率识别和定量评估细胞转录本中的 m6A 修饰水平。这些数据支持对感染相关 RNA 甲基化变化的研究，包括 m6A 沉积、可变多聚腺苷酸化、转录本结构和宿主抗病毒反应之间的关系。该数据集有助于更广泛地研究 RNA 切割和多聚腺苷酸化因子如何
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB106901
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究采用乙二醛和亚硝酸盐介导的未甲基化腺苷脱氨基作用，随后进行RNA测序（GLORI-seq），以表征寨卡病毒（ZIKV）感染期间转录组范围的N6-甲基腺苷（m6A）RNA修饰动态。在感染后48小时，从模拟感染和ZIKV感染的人Huh7肝癌细胞中分离poly(A)富集的RNA，每种条件设置三个独立生物学重复。GLORI-seq能够以单核苷酸分辨率鉴定和定量评估细胞转录本中m6A修饰水平。这些数据支持对感染相关RNA甲基化变化的研究，包括m6A沉积、选择性多聚腺苷酸化、转录本结构与宿主抗病毒反应之间的关系。该数据集有助于更广泛地研究RNA切割和多聚腺苷酸化因子CSTF2和CSTF2T如何在病毒感染期间调控转录本选择性的m6A沉积。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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