ASFV Lv17/WB/Rie1-dCD体内传代后基因组测序

该数据集包含非洲猪瘟病毒DNA的全基因组测序输出,来自突变亲本株Lv17/WB/Rie1-dCD(GenBank登录号PQ284530)在猪体内连续传代获得的六个样本(E1至E6),涵盖传代0至传代6

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基因组分类Other疫苗编码
PRJEB105327: Genome sequencing of ASFV Lv17/WB/Rie1-dCD after in vivo passages

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

ASFV Lv17/WB/Rie1-dCD体内传代后基因组测序

该数据集包含非洲猪瘟病毒DNA的全基因组测序输出,来自突变亲本株Lv17/WB/Rie1-dCD(GenBank登录号PQ284530)在猪体内连续传代获得的六个样本(E1至E6),涵盖传代0至传代6。数据由西班牙CISA(INIA-CSIC)在欧盟VACDIVA项目框架下产生并提交,主要目的是研究疫苗候选株Lv17/WB/Rie1-dCD在体内传代过程中的遗传稳定性。该数据可用于分析病毒基因组在宿主体内传代时的变异情况,评估疫苗候选株的遗传稳定性(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本数据集包含非洲猪瘟病毒DNA的全基因组测序输出,来自六个体内传代样本(毒株E1至E6),这些样本获自突变亲本株Lv17/WB/Rie1-dCD(GenBank登录号PQ284530)。毒株E1为亲本株(传代0:PQ284530),毒株E2为该株的传代1(P1-DP),毒株E3为传代4(P4-DP),毒株E4为传代5(P5-DP),毒株E5和E6均为传代6(P6-DP),分别来自两头不同的猪。主要目的是研究疫苗候选株Lv17/WB/Rie1-dCD在家猪体内传代过程中的遗传稳定性。这六个基因组由动物卫生研究中心(CISA,INIA-CSIC,西班牙马德里)在欧盟VACDIVA项目内获得并提交。

【主题与分类】

主题标签:Other。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB105327

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含非洲猪瘟病毒DNA的全基因组测序结果,这些DNA来自六个体内传代样本(毒株E1至E6),源自突变亲本株Lv17/WB/Rie1-dCD(GenBank登录号PQ284530)。其中,E1株为亲本株(第0代:PQ284530),E2株为该株的第1代(P1-DP),E3株为第4代(P4-DP),E4株为第5代(P5-DP),而E5和E6株均为第6代(P6-DP),分别来自两头不同的猪。主要目的是通过在家猪体内的传代,研究候选疫苗Lv17/WB/Rie1-dCD的遗传稳定性。这六个基因组由西班牙马德里的动物卫生研究中心(CISA, INIA-CSIC)在欧盟VACDIVA项目框架内获得并保存。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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