PRJEB102391：巴基斯坦肉鸡感染新城疫病毒WGS数据集

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PRJEB102391：巴基斯坦肉鸡感染新城疫病毒WGS数据集

PRJEB102391 是一个面向新城疫病毒感染研究的鸡全基因组测序数据集，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），收录于感染性疾病 / 其他分类之下，主题标签为 Other。该数据集以巴基斯坦肉鸡为研究对象，围绕新城疫病毒攻毒实验展开，共包含 8 个测序样本，其中 4 个来自肉鸡对照组，4 个来自未接种疫苗的攻毒组。整体而言，该数据集提供了对照组与未免疫攻毒组肉鸡的全基因组测序数据，可用于比较两组宿主在病毒感染背景下的基因组层面差异，为新城疫病毒感染的宿主遗传机制研究提供原始测序数据基础。

【数据集背景】

新城疫是由新城疫病毒引起的一种禽类重要传染病，对家禽养殖业危害显著。该数据集以巴基斯坦肉鸡为对象，设置对照组与未接种疫苗的攻毒组，通过全基因组测序获取宿主遗传信息，服务于新城疫病毒感染相关研究。数据集的英文名称为 PRJEB102391: WGS dataset of Pakistani broilers challenged with Newcastle disease virus，直接表明了其研究对象（巴基斯坦肉鸡）、实验处理（新城疫病毒攻毒）与技术手段（全基因组测序）。在分类上，该数据集归入感染性疾病 / 其他类别，主题标签为 Other。

【数据内容】

该数据集共包含 8 个样本，样本构成明确分为两组：4 个样本来自肉鸡对照组（Broiler Control），4 个样本来自未接种疫苗的攻毒组（Broiler Non-vaccinated challenged group）。数据内容为上述样本的全基因组测序数据。除样本数量与分组信息外，源站未提供关于测序平台、测序深度、读长、数据量、文件格式等更详细的技术参数。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），研究对象为巴基斯坦肉鸡。实验设计包含对照组与未接种疫苗的攻毒组，攻毒处理为新城疫病毒。关于样本采集的具体地点、时间、动物日龄、饲养条件、病毒株信息以及测序实验的具体流程，源站未提供。

【适用场景】

基于其样本构成与实验设计，该数据集适用于新城疫病毒感染的宿主基因组学研究，例如比较对照组与未接种疫苗攻毒组肉鸡在全基因组层面的差异，探索与病毒感染相关的宿主遗传变异；也可作为禽类感染性疾病研究中全基因组测序数据的参考或对照数据使用。关于该数据集在其他具体研究方向上的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）获取，具体访问编号为 PRJEB102391。关于数据下载方式、文件组织方式、数据处理与分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集样本量较小，共 8 个样本，且仅包含对照组与未接种疫苗攻毒组两组，未涉及其他处理组别。关于数据质量评估指标、测序覆盖度、是否存在低质量样本或数据过滤情况，源站未提供。使用时应结合具体研究目的对数据适用性加以判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可信息，源站未提供。