基本信息

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创建/更新时间

2026-10-22

资源简介

PRJDB44883：蜱中田鼠巴贝虫（PRJCA058777）

PRJDB44883: Babesia microti in ticks (PRJCA058777) 是一个围绕蜱与田鼠巴贝虫（Babesia microti）相互作用展开的研究数据集，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站对该数据集的描述为“Transcriptome analysis reveals tick microRNAs restrict Babesia microti infection”，即通过转录组分析揭示蜱 microRNA 对田鼠巴贝虫感染的限制作用。该数据集在本站归类于感染性疾病 / 其他，主题标签为 Other。整体来看，数据内容涉及蜱与田鼠巴贝虫之间的相互作用，涵盖转录组分析与 microRNA 相关研究内容，可用于感染性疾病领域的相关分析。

【数据集背景】

该数据集聚焦于蜱与田鼠巴贝虫之间的感染关系。田鼠巴贝虫是一种与蜱媒传播相关的病原体，源站描述所指向的研究主题是蜱的 microRNA 在限制田鼠巴贝虫感染中所发挥的作用。围绕这一主题，研究采用转录组分析作为主要技术路径，从转录组层面考察蜱与病原体相互作用过程中的分子变化。数据集的英文名称为 PRJDB44883: Babesia microti in ticks (PRJCA058777)，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站将其归入感染性疾病 / 其他分类，主题标签为 Other。该数据集因此属于感染性疾病研究领域中以蜱媒与病原体互作为核心的一类数据资源。

【数据内容】

依据源站描述，该数据集的内容围绕转录组分析与 microRNA 相关研究展开，研究对象为蜱与田鼠巴贝虫。数据所对应的研究主题是揭示蜱 microRNA 对田鼠巴贝虫感染的限制作用，因此其内容涉及蜱在感染田鼠巴贝虫条件下的转录组层面信息以及 microRNA 相关研究内容。数据集的主题标签为 Other，本站分类为感染性疾病 / 其他。除上述围绕转录组分析与 microRNA 的研究内容外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型与具体字段构成的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为 PRJDB44883: Babesia microti in ticks (PRJCA058777)。源站描述为“Transcriptome analysis reveals tick microRNAs restrict Babesia microti infection”。关于样本采集地点、采集时间、蜱的物种与发育阶段、感染方式与实验设计等具体采集信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集围绕蜱与田鼠巴贝虫的相互作用，涉及转录组分析与 microRNA 相关研究内容，可用于感染性疾病领域的相关分析。其潜在适用方向包括：考察蜱 microRNA 在限制田鼠巴贝虫感染过程中的作用、从转录组层面分析蜱对田鼠巴贝虫感染的分子响应，以及围绕蜱媒与病原体互作开展感染性疾病领域的比较与整合分析。上述适用方向均以源站描述所体现的研究主题为依据；关于具体分析流程与适用范围，源站未提供更多说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据获取方式、文件组织方式、预处理步骤与分析流程等均未说明。使用者需依据来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的公开信息自行确认获取与使用方式。

【质量与限制】

该数据集的质量信息，如数据完整性、测序深度、重复数量与质控结果等，源站未提供。其限制方面，源站描述仅给出研究主题层面的概括，未提供样本规模、实验条件与技术细节，因此在使用时需注意数据覆盖范围与适用条件的边界。本站分类为感染性疾病 / 其他，主题标签为 Other，相关分类信息较为概括，不宜据此推断更细粒度的数据属性。

【引用与许可】

该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。使用时应遵循来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的相关规定，具体引用格式与使用许可需以来源站的公开说明为准。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB44883

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB44883

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Transcriptome analysis reveals tick microRNAs restrict Babesia microti infection

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别