PRJDB43322:新型Iflavirus的RNA-SEQ(PRJCA024612)

项目旨在青藏高原、东部丘陵、东南沿海及重要岛屿等病媒生物与疾病复杂多样区域,建立反向病因监测示范基地,针对病媒携带新病原体、新病媒、暴露人群及畜禽,以及粮食和经济作物病虫害与昆虫介体携带新病原体开展感染研究,通过核酸检测、宏基因组/转录组测序结合病原分离培养研究新病原体的媒介宿主、致病特征和传播规律

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基因组Other
PRJDB43322: RNA-SEQ of new Iflavirus (PRJCA024612)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJDB43322:新型Iflavirus的RNA-SEQ(PRJCA024612)

该数据集为PRJDB43322项目下的RNA-SEQ数据,关联PRJCA024612,聚焦新型Iflavirus。项目旨在青藏高原、东部丘陵、东南沿海及重要岛屿等病媒生物与疾病复杂多样区域,建立反向病因监测示范基地,针对病媒携带新病原体、新病媒、暴露人群及畜禽,以及粮食和经济作物病虫害与昆虫介体携带新病原体开展感染研究,通过核酸检测、宏基因组/转录组测序结合病原分离培养研究新病原体的媒介宿主、致病特征和传播规律,并建立病媒生物安全战略资源信息数据库。数据可用于新病原体发现、病媒传播机制及生物安全监测研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为在我国病媒生物及其疫源地与疾病复杂多样的青藏高原、东部丘陵地区、东南沿海和重要岛屿建立反向病因监测示范基地。在这些地区开展病媒携带新病原体和新病媒、暴露人群及畜禽动物的感染,并开展粮食和经济作物病害与昆虫介体携带新病原体的感染;通过核酸检测、宏基因组/转录组测序结合病原分离培养研究新病原体的媒介宿主、致病特征和传播规律。利用本项目产生的新病原数据、病媒样本资源和生态数据,建立病媒生物安全战略资源信息数据库。根据该

【主题与分类】

主题标签:Other。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB43322

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在我国青藏高原、东部丘陵地区、东南沿海及重要岛屿等病媒生物及其疫源地与疾病复杂多样地区,建立反向病因学监测示范基地。在这些地区开展病媒生物携带新病原体及新病媒生物、暴露人群和牲畜动物的感染情况调查,并开展粮食作物和经济作物中植物病害及昆虫媒介携带新病原体的感染情况调查;通过核酸检测、宏基因组/转录组测序结合病原分离培养,研究新病原体的媒介宿主、致病特征和传播规律。利用本项目产生的新病原学数据、媒介样本资源和生态学数据,建立媒介生物安全战略资源库信息数据库。

基于节肢动物衍生的受威胁动植物的比较研究,探索其携带病原体的宿主媒介适应策略;开展新病原体导致新疾病的风险评估,并建立新病原体的传染病风险评估与预警模型及预警平台。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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