新热带两栖动物后疫情期微生物组关联数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aeee078a3da6856aa87fe03126701c1dbf92ebdcd6704555c6082976cee2f9a99

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

微生物组-病原体相互作用日益被视为宿主免疫的重要组成部分。尽管这些宿主层面的相互作用会对群落疾病动态产生影响，但在更大尺度上影响宿主微生物组的因素却知之甚少。我们在此描述了在后疫情时代两栖动物壶菌病背景下的景观尺度病原体-微生物组关联，该疾病由泛动物流行病性壶菌真菌Batrachochytrium dendrobatidis引起。在观察到两栖动物种群下降约30年后，我们对厄瓜多尔沿海拔梯度分布的新热带两栖动物进行了调查，并采集了皮肤拭子样本，使用真菌（ITS-2）和细菌（r16S）扩增子进行了宏条形码分析。我们的数据揭示了B. dendrobatidis感染模式和微生物组结构中与宿主生活史相关的显著变异。溪流繁殖的两栖动物最易感染B. dendrobatidis。这种增加的感染概率……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。