参考化合物对26种HDAC同源物的pIC50值

profile化合物的pIC50值,针对26种人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体及细菌同源物。数据来自荧光酶活性测定中的10点剂量反应曲线

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2026-10-11 更新
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基因组回归HDACpIC50酶活性测定剂量反应曲线感染性疾病参考化合物
pIC50 values for reference compounds against 26 HDAC homologs

基本信息

模态
基因组
大小
0.000025687 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

参考化合物对26种HDAC同源物的pIC50值

本数据集收录了一组参考化合物对多种组蛋白去乙酰化酶(HDAC)同源物的pIC50值,覆盖26种人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体以及细菌同源物。数据来源于荧光酶活性测定中的10点剂量反应曲线,以pIC50形式量化化合物对各类HDAC靶标的抑制活性。该数据集由Kopranovic, Aleksandra、Münster, Hannah、Groll, Louis、Almstätter, Florian和Meyer-Almes, Franz-Josef共同完成,发布于Zenodo平台,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,发布时间为2026年。数据集在本站归类于感染性疾病/其他类别,来源站为doi.org。整体而言,该数据集为HDAC抑制剂的活性评价与选择性分析提供了系统性的定量参考数据。

【数据集背景】

组蛋白去乙酰化酶(HDAC)是一类在表观遗传调控中发挥关键作用的酶,参与染色质重塑、基因表达调控以及多种细胞过程。HDAC家族包含多个同源物,不同同源物在生理功能、组织分布和病理关联上存在差异。针对HDAC的抑制剂开发是药物研究的重要方向,尤其在肿瘤、感染性疾病及免疫相关疾病等领域受到广泛关注。为了评估化合物的抑制活性与选择性,需要获取化合物对多种HDAC同源物的定量活性数据。本数据集正是在这一背景下产生,旨在提供参考化合物对26种人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体及细菌同源物的pIC50值,为HDAC抑制剂的活性谱分析和选择性评价提供基础数据支持。

【数据内容】

数据集的核心内容为参考化合物对多种HDAC同源物的pIC50值。具体靶标范围包括26种人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体以及细菌同源物。pIC50是半数抑制浓度的负对数,数值越大表示化合物对靶标的抑制活性越强。数据以pIC50形式呈现,便于在不同化合物和不同靶标之间进行活性比较。源站描述指出,这些数据来自荧光酶活性测定中的10点剂量反应曲线,说明每个化合物的活性数据基于多点浓度梯度拟合获得,而非单点测定。数据集涵盖的化合物为profile化合物,即一组用于活性谱分析的参考化合物。除上述信息外,关于化合物的具体数量、分子结构、靶标的具体亚型列表、突变变体的具体类型以及细菌同源物的具体物种来源,源站未提供。

【采集与来源】

数据由Kopranovic, Aleksandra、Münster, Hannah、Groll, Louis、Almstätter, Florian和Meyer-Almes, Franz-Josef共同采集和整理。采集方法为荧光酶活性测定,采用10点剂量反应曲线获取化合物的抑制活性数据。数据发布于Zenodo平台,来源站为doi.org。发布时间为2026年。关于实验的具体条件,如缓冲液组成、底物种类、酶浓度、孵育时间、检测仪器型号等,源站未提供。关于数据采集的实验室环境、重复次数、独立实验批次等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于HDAC抑制剂的活性评价与选择性分析。研究人员可以利用这些pIC50值比较不同参考化合物对多种HDAC同源物的抑制强度,进而分析化合物的选择性谱。由于数据覆盖人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体及细菌同源物,可用于跨物种或跨变体的活性比较研究。在药物发现早期阶段,该数据集可作为参考基准,用于评估新化合物的活性水平。此外,该数据集也可用于构建或验证计算模型,如定量构效关系模型或机器学习模型,以预测化合物对HDAC同源物的抑制活性。在感染性疾病相关研究中,细菌同源物的抑制数据可能为抗菌药物开发提供参考。关于该数据集是否已用于特定研究或是否与特定疾病模型直接关联,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过来源站doi.org获取该数据集。数据以pIC50值形式提供,可直接用于统计分析或与其他活性数据进行比较。在使用时,建议注意pIC50值的靶标对应关系,确保比较的是同一同源物或同一变体。由于数据来自10点剂量反应曲线,使用者可依据pIC50值判断化合物的活性强弱,但需注意不同实验条件可能影响数据的可比性。关于数据的具体文件格式、数据结构、是否包含原始剂量反应曲线数据、是否提供元数据说明文件等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可的要求。

【质量与限制】

该数据集基于荧光酶活性测定中的10点剂量反应曲线,这一方法通常能够提供较为可靠的剂量依赖性抑制数据。然而,关于实验的重复次数、标准差、置信区间等统计信息,源站未提供。数据覆盖26种人源HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体及细菌同源物,但具体靶标列表、突变变体的具体类型以及细菌同源物的具体来源,源站未提供。此外,关于化合物的纯度、溶解度、实验中的最大浓度范围等信息,源站未提供。使用者应注意,pIC50值可能受实验条件影响,不同实验室或不同测定方法获得的数据可能存在差异。该数据集未提供原始剂量反应曲线数据,可能限制使用者对数据质量的进一步评估。

【引用与许可】

该数据集的作者为Kopranovic, Aleksandra、Münster, Hannah、Groll, Louis、Almstätter, Florian和Meyer-Almes, Franz-Josef。数据发布于Zenodo平台,发布时间为2026年。许可方式为Creative Commons Attribution 4.0 International,允许在署名的前提下共享和改编数据。使用者在引用该数据集时,应按照学术规范注明作者、数据集名称、来源站及许可信息。关于具体的引用格式或DOI标识符,源站未提供。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 25.7 KB。

数据说明

profile化合物对26种人HDAC、斑马鱼HDAC10、突变变体及细菌同源物的pIC50值。数据来源于荧光酶活性测定中的10点剂量-反应曲线。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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