巴拿马两栖动物共生细菌抑制致命真菌病原体蛙壶菌生长的系统发育分布

该数据集来自search.dataone.org,聚焦巴拿马两栖动物皮肤共生细菌的系统发育分布及其抗真菌功能。研究者从两栖动物皮肤培养超过450株细菌分离株,利用体外挑战实验测试其与致死性真菌病原体Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)的相互作用,并对部分分离株开展共培

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基因组分类antifungalSecondary metabolitesprobioticBatrachochytrium dendrobatidisdiseasechytridiomycosisSkin bacteria
Phylogenetic distribution of symbiotic bacteria from Panamanian amphibians that inhibit growth of the lethal fungal pathogen Batrachochytrium dendrobatidis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

巴拿马两栖动物共生细菌抑制致命真菌病原体蛙壶菌生长的系统发育分布

Phylogenetic distribution of symbiotic bacteria from Panamanian amphibians that inhibit growth of the lethal fungal pathogen Batrachochytrium dendrobatidis

该数据集来自search.dataone.org,聚焦巴拿马两栖动物皮肤共生细菌的系统发育分布及其抗真菌功能。研究者从两栖动物皮肤培养超过450株细菌分离株,利用体外挑战实验测试其与致死性真菌病原体Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)的相互作用,并对部分分离株开展共培养实验。数据可用于探究皮肤细菌对Bd的抑制能力、防御性功能性状的分布,以及益生菌和抗真菌代谢产物在壶菌病防控中的潜在作用(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):下一代测序的引入使人们能够更深入地了解共生微生物群落的组成。然而,确定这些微生物群落中各个成员的功能仍主要依赖于基于培养的方法。在此,我们展示了与两栖动物相关的培养共生细菌的防御性功能性状的系统发育分布结果。两栖动物宿主拥有多样化的皮肤细菌群落,其中一些细菌通过分泌抗真菌代谢产物保护宿主免受致死性真菌病原体Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)的侵害。我们从巴拿马两栖动物物种的皮肤中培养了超过450株细菌分离株,并使用体外挑战实验测试了它们与Bd的相互作用。对于一部分分离株,我们还完成了共培养实验,并发现培养分离株

【主题与分类】

主题标签:antifungal、Secondary metabolites、probiotic、Batrachochytrium dendrobatidis、disease、chytridiomycosis、Skin bacteria。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad470e767fdbc38ef10dc373a637d74d530293975c26406db0522f2a52c398061

使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad470e767fdbc38ef10dc373a637d74d530293975c26406db0522f2a52c398061

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

下一代测序技术的引入使人们对共生微生物群落的组成有了更深入的了解。然而,确定这些微生物群落中各个成员的功能在很大程度上仍依赖于基于培养的方法。在此,我们展示了与两栖动物相关的可培养共生细菌中一种防御性功能性状的系统发育分布结果。两栖动物是皮肤细菌多样群落的宿主,其中一些细菌通过分泌抗真菌代谢物保护宿主免受致死性真菌病原体蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis,Bd)的侵害。我们从巴拿马两栖动物物种的皮肤中培养了超过450株细菌分离株,并使用体外挑战试验测试了它们与Bd的相互作用。对于一部分分离株,我们还完成了共培养实验,发现将分离株与Bd共培养对细菌的抑制特性没有影响,但显著降低了m……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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