分子相互作用数据库
自2013年9月起,MINT 使用 IntAct 数据库基础设施,以减少重复工作并优化未来的软件开发。由 MINT 审编人员人工审编的数据现可从 EBI 的 IntAct 主页访问

基本信息
资源简介
分子相互作用数据库
Molecular INTeraction Database(MINT)是一个公共的分子相互作用数据库,收录来自同行评审期刊报道的分子相互作用信息。自2013年9月起,MINT 采用 IntAct 数据库基础设施,以减少重复性工作并优化未来的软件开发。由 MINT 审编人员人工审编的数据现可从 EBI 的 IntAct 主页访问。MINT 的数据维护与发布、MINT PSICQUIC 和 IMEx 服务由 IntAct 团队负责,审编工作由双方团队共同承担。MINT 开发团队目前专注于两项新工作:mentha 和 SIGNOR。该数据集在本站归入感染性疾病 / 其他分类,来源站为 mint.bio.uniroma2.it。
【数据集背景】
MINT 是一个公共存储库,专门收录在同行评审期刊中报道的分子相互作用。随着数据规模和协作需求的变化,MINT 自2013年9月起转向使用 IntAct 数据库基础设施,目的在于限制重复性工作,并为后续软件开发优化基础。这一调整也带来了职责分工的变化:数据维护与发布、MINT PSICQUIC 和 IMEx 服务由 IntAct 团队承担责任,而审编工作则由相关团队共同承担。与此同时,MINT 开发团队将精力转向两项新的发展方向:mentha 和 SIGNOR。其中 mentha 整合由 IMEx 数据库审编的蛋白质相互作用信息,SIGNOR 则是一个关于人类蛋白质之间逻辑关系的数据库。
【数据内容】
MINT 的核心内容是分子相互作用信息,这些信息来源于同行评审期刊的报道,并经过人工审编。作为公共存储库,它面向分子相互作用数据的检索与利用。就本站分类而言,该数据集被归入感染性疾病 / 其他类别。关于数据的具体条目数量、覆盖物种范围、相互作用类型细分、更新频率等细节,源站未提供。
【采集与来源】
MINT 的数据来自同行评审期刊中报道的分子相互作用,并由 MINT 审编人员进行人工审编。自2013年9月起,这些人工审编的数据可从 EBI 的 IntAct 主页访问。数据维护与发布以及 MINT PSICQUIC 和 IMEx 服务由 IntAct 团队负责,审编工作由双方团队共同承担。关于原始文献筛选标准、审编流程的具体步骤、数据提交渠道等细节,源站未提供。
【适用场景】
MINT 作为分子相互作用的公共存储库,可用于查找和分析分子相互作用信息。其数据可通过 EBI 的 IntAct 主页访问,并涉及 MINT PSICQUIC 和 IMEx 服务。MINT 开发团队关注的两项新工作中,mentha 整合由 IMEx 数据库审编的蛋白质相互作用信息,SIGNOR 涉及人类蛋白质之间的逻辑关系。关于具体的分析流程、可视化能力或通路展示功能,源站未提供。
【使用方法】
由 MINT 审编人员人工审编的数据现可从 EBI 的 IntAct 主页访问。MINT PSICQUIC 和 IMEx 服务由 IntAct 团队负责。关于访问接口的具体调用方式、查询语法、批量下载途径等细节,源站未提供。
【质量与限制】
MINT 的数据经过人工审编,这一过程由 MINT 审编人员完成,审编工作现由相关团队共同承担。自2013年9月起采用 IntAct 数据库基础设施,旨在减少重复工作并优化软件开发。关于数据准确性评估、覆盖完整性、已知偏差或使用限制等具体说明,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://mint.bio.uniroma2.it/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
自2013年9月起,MINT利用IntAct数据库基础设施来限制重复工作并优化未来的软件开发。由MINT策展人手动整理的数据现在可以从EBI的IntAct主页访问。数据维护与发布、MINT PSICQUIC和IMEx服务由IntAct团队负责,而策展工作将由两个团队共同承担。MINT开发团队现在专注于两项新开发:mentha,它整合了由IMEx数据库策展的蛋白质相互作用信息;以及SIGNOR,一个人类蛋白质间逻辑关系的数据库。MINT是一个公开的分子相互作用库,收录了同行评审期刊中报道的分子相互作用。它是一个分子相互作用数据库集合,可用于搜索、分析并以图形方式展示来自多种物种的分子相互作用网络和通路。MINT由多个独立的数据库组件构成。HomoMINT是一个推断的人类蛋白质相互作用数据库。Domino是一个结构域肽相互作用数据库。新增了一个名为VirusMINT的组件,用于探索病毒蛋白与人类蛋白质之间的相互作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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