不同TB患者巨噬细胞的miRNA表达谱
该数据集来自omicsdi.org，收录了活动性MTB病、潜伏感染（LTBI）和健康对照三组个体的巨噬细胞miRNA表达谱
基本信息
资源简介
不同TB患者巨噬细胞的miRNA表达谱
该数据集名为 miRNA profile of macrophage from different TB patients，来自 omicsdi.org，主题标签为 Transcriptomics，在本站归类于感染性疾病 / 其他。数据集收录了活动性 MTB 病、潜伏感染（LTBI）和健康对照三组个体的巨噬细胞 miRNA 表达谱，研究借助微阵列技术对宿主巨噬细胞的 microRNA 谱进行刻画。样本来自一个小规模队列，涵盖健康对照、潜伏感染者和活动性结核病患者三类人群，先采集全血分离单核细胞，再在体外诱导为巨噬细胞并提取总 RNA 用于 miRNA 谱分析。整体而言，该数据集围绕结核感染不同状态下宿主巨噬细胞的 miRNA 表达差异，为感染性疾病相关的转录组研究提供了可参考的表达谱资源。
【数据集背景】
结核病由结核分枝杆菌（MTB）感染引起，感染结局在个体间差异明显：部分人发展为活动性 MTB 病，部分人处于潜伏感染（LTBI）状态而不发病，还有一部分人保持健康。宿主免疫细胞尤其是巨噬细胞在感染过程中发挥关键作用，而 microRNA 作为基因表达的重要调控分子，可能参与塑造巨噬细胞对 MTB 的应答。该数据集正是在这一背景下，针对活动性 MTB 病、潜伏感染和健康对照三类个体的巨噬细胞开展 miRNA 谱研究，试图从转录后调控层面呈现不同感染状态下的宿主细胞特征。
【数据内容】
数据集的核心内容是宿主巨噬细胞的 microRNA 表达谱，通过微阵列（microarray）技术获得。研究对象覆盖三个队列：健康对照（n=3）、潜伏感染者（n=4）和活动性 TB 患者（n=3）。每个个体均采集全血标本用于单核细胞分离，随后在体外将单核细胞诱导为巨噬细胞，并提取总 RNA 进行 miRNA 谱分析。因此，数据集所记录的是以个体为单位的巨噬细胞 miRNA 表达测量结果，可用于比较三类人群之间 miRNA 表达模式的异同。主题标签为 Transcriptomics，表明其属于转录组学范畴的表达谱数据。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。样本采集流程为：从三个队列的每位个体采集全血标本，分离单核细胞，在体外诱导单核细胞分化为巨噬细胞，提取总 RNA 后用于 miRNA 谱分析。三个队列的样本量分别为健康对照 3 例、潜伏感染 4 例、活动性 TB 患者 3 例，合计 10 例个体。源站描述将这一研究设计概括为在小型队列中借助微阵列研究宿主巨噬细胞的 microRNA 谱。除上述信息外，采样时间、地点、人群特征等细节源站未提供。
【适用场景】
基于其设计，该数据集适用于以下方向：比较活动性 MTB 病、潜伏感染与健康对照三类个体巨噬细胞 miRNA 表达谱的差异；探索与结核感染状态相关的宿主 miRNA 候选分子；作为感染性疾病转录组研究中的参考表达谱，用于方法学比较或与其他结核相关表达数据联合分析；在宿主—病原相互作用和巨噬细胞免疫调控的研究中提供背景性数据支持。由于样本量较小，该数据集更适合探索性分析和假设生成，而非用于确证性统计推断。
【使用方法】
使用时可依据样本分组信息（健康对照、潜伏感染、活动性 TB）对 miRNA 表达谱进行分组比较，识别组间差异表达的 miRNA；也可将表达谱作为整体特征，考察三类样本在表达模式上的聚类关系。分析前应关注数据是否经过标准化处理以及原始与处理后数据的区别，源站未提供具体说明。若与其他转录组数据整合，需注意平台、样本处理和表达定量方式的一致性。涉及临床分组的研究应结合感染状态定义和样本来源信息谨慎解释结果。
【质量与限制】
该数据集的主要限制在于样本规模很小：健康对照 3 例、潜伏感染 4 例、活动性 TB 患者 3 例，合计仅 10 例，组间比较的统计效力有限，结果易受个体差异影响。研究采用微阵列技术检测 miRNA 谱，其动态范围和特异性受平台特性制约。样本经过全血采集、单核细胞分离和体外诱导为巨噬细胞等多步处理，体外培养条件可能影响 miRNA 表达谱，与体内状态存在差异。此外，关于测序深度、标准化方法、数据质控指标、临床元数据完整度等信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 omicsdi.org，具体引用方式、原始文献信息、数据许可条款及使用限制源站未提供。使用者在下载、再分发或发表基于该数据集的分析结果前，应自行向源站核实相关引用要求和许可条件。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-65810
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过微阵列技术，对一小群活动性MTB疾病患者、潜伏感染(LTBI)者及健康对照者的宿主巨噬细胞microRNA谱进行了研究。从三个队列中的每个个体——健康组(n=3)、潜伏感染组(n=4)和活动性结核病患者组(n=3)——收集全血标本以分离单核细胞。在体外将单核细胞诱导为巨噬细胞，并提取总RNA用于miRNA谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
