Integrator复合体亚基12敲除克服HIV潜伏逆转的转录阻滞

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A09e3f31a4592699c928a043e11eb09bbce3df97a259a2f233dd7b87beeba9bc5

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数据说明

潜伏的HIV储存库是治愈HIV的主要障碍。将作用机制不同的潜伏逆转剂（LRAs）联合使用，例如非经典NF-kB激活剂AZD5582与溴结构域抑制剂I-BET151，对于诱导HIV-1再激活具有吸引力。然而，即便是这种LRA联合方案也需要改进，因为其在激活HIV感染者（PLWH）细胞中的前病毒方面效率不高。在本研究中，我们结合AZD5582与I-BET151进行了CRISPR筛选，并鉴定出Integrator复合体的一个成员可作为改进该LRA联合方案的靶点，具体为Integrator复合体亚基12（INTS12），因为我们观察到该基因相较于所有其他基因出现富集。Integrator作为一个全基因组范围的转录衰减器，通过其RNA切割和磷酸酶模块作用于延伸过程。我们观察到，与安全港位点AAVS1敲除相比，INTS12的敲除在J-lat细胞中于转录水平改善了潜伏再激活。

INTS…, # 整合素复合体亚基12敲除克服了HIV潜伏逆转的转录障碍 数据集DOI：10.5061/dryad.qfttdz0t0 ## 数据与文件结构说明 本数据旨在评估INTS12敲除单独作用及在AZD5582与I-BET151存在下对HIV潜伏逆转的影响。 ### 文件与变量 #### 文件：250323_DryadInformation.xlsx 描述： 该Excel文件共包含14个工作表：工作表1为包含一般信息的说明页，工作表2-8对应手稿中的各主图（例如：Figure1），工作表9-14对应手稿中的各补充图（例如：Figure1_Supp1表示图1补充图1）。每个工作表包含与特定图相关的所有数据（例如图1将包含图1B和1C的信息，因这些部分含有图形数据），其格式尽可能贴近数据绘图时的原始形式。因此，部分数值可能包含在单独…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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