幽门螺杆菌oipA“开”与“关”临床株体外感染AGS细胞系揭示外膜炎症蛋白A(OipA)抑制凋亡
主题标签:幽门螺杆菌、oipA、OipA、AGS细胞系、凋亡、感染性疾病。本数据集为感染性疾病领域公开数据集,主题涵盖幽门螺杆菌。

基本信息
资源简介
幽门螺杆菌oipA“开”与“关”临床株体外感染AGS细胞系揭示外膜炎症蛋白A(OipA)抑制凋亡
该数据集英文名称为“In vitro infection of AGS cell line with Helicobacter pylori oipA ‘on’ and ‘off’ clinical strains revealed that Outer Inflammatory Protein A (OipA) suppresses apoptosis”,来自 ebi.ac.uk,本站归类为感染性疾病 / 其他。数据集围绕幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)oipA“开”与“关”临床菌株体外感染 AGS 细胞系的实验展开,主题标签包括幽门螺杆菌、oipA、OipA、AGS 细胞系、凋亡与感染性疾病。其核心科学指向是:外膜炎症蛋白 A(Outer Inflammatory Protein A,OipA)对凋亡具有抑制作用。该数据集为感染性疾病领域的公开数据集,主题涵盖幽门螺杆菌,可用于了解相关体外感染实验所产生的研究数据。
【数据集背景】
幽门螺杆菌是一种与胃部疾病密切相关的病原体,其致病机制研究常借助体外细胞感染模型开展。AGS 细胞系是相关研究中常用的胃上皮细胞模型。oipA 基因及其编码的外膜炎症蛋白 A(OipA)是幽门螺杆菌研究中的关注对象之一。该数据集所对应的研究以 oipA“开”与“关”的临床菌株分别感染 AGS 细胞系,通过体外实验比较不同 oipA 状态下的感染结果,研究结论指向 OipA 对凋亡的抑制作用。数据集即围绕这一研究主题组织与公开。
【数据内容】
该数据集的主题标签涵盖幽门螺杆菌、oipA、OipA、AGS 细胞系、凋亡与感染性疾病,表明其内容与上述体外感染实验相关。数据集的英文名称明确描述了实验对象与实验设计要点,即 AGS 细胞系、幽门螺杆菌 oipA“开”与“关”临床菌株的体外感染,以及 OipA 抑制凋亡的研究发现。除这些主题与标题信息外,源站未提供关于数据文件类型、样本数量、实验分组细节、检测指标数值等更具体的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中给出的数据集条目为“Anis Al-Maleki, In vitro infection of AGS cell line with Helicobacter pylori oipA ‘on’ and ‘off’ clinical strains revealed that Outer Inflammatory Protein A (OipA) suppresses apoptosis [Dataset]”,并附有项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005020。由此可知其来源站为 ebi.ac.uk,数据集与上述研究作者及项目条目相对应。关于样本采集地点、采集时间、实验操作流程等更详细的采集信息,源站未提供。
【适用场景】
基于数据集的主题与标题信息,该数据集适用于感染性疾病领域特别是幽门螺杆菌相关研究的参考与再利用,可用于关注 oipA“开”与“关”临床菌株体外感染 AGS 细胞系的实验场景,以及围绕 OipA 与凋亡关系的研究主题。对于需要了解该研究方向公开数据资源的使用者,该数据集可作为检索与获取相关数据的入口。除上述主题层面的适用方向外,源站未提供关于具体分析用途、适用模型或验证场景的进一步说明。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的公开项目页面提供访问,项目链接为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005020。使用者可依据该链接定位数据集条目并获取源站公开的信息与数据。关于数据下载格式、文件组织方式、预处理步骤或分析工具等具体使用方法,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为感染性疾病领域的公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,并具有明确的研究标题与项目条目。其主题标签清晰指向幽门螺杆菌、oipA、OipA、AGS 细胞系与凋亡等关键词。关于数据质量评估指标、数据完整性、批次信息、技术验证结果以及使用中的具体限制,源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参照源站描述中的条目信息:“Anis Al-Maleki, In vitro infection of AGS cell line with Helicobacter pylori oipA ‘on’ and ‘off’ clinical strains revealed that Outer Inflammatory Protein A (OipA) suppresses apoptosis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005020”。关于该数据集的许可条款与使用授权细节,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005020
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Anis Al-Maleki,用幽门螺杆菌oipA“开启”和“关闭”临床菌株体外感染AGS细胞系的研究显示,外膜炎症蛋白A(OipA)抑制细胞凋亡[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005020
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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