抗生素治疗与拔牙对口腔微生物组的影响
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦阻生第三磨牙拔除治疗中常规使用阿莫西林对口腔微生物组稳定性的影响。研究通过16S rDNA基因测序评估5个时间点不同细菌的相对丰度,并利用已知耐药基因微阵列和功能宏基因组学分析耐药基因的相对丰度与表达;次要指标包括唾液C反应蛋白水平及临床炎症感染

基本信息
资源简介
抗生素治疗与拔牙对口腔微生物组的影响
该数据集英文名为“Impact of Antibiotic Treatment and Extraction on the Oral Micro Biome”,来源于clinicaltrials.gov,本站归类为感染性疾病/其他。数据集聚焦阻生第三磨牙拔除治疗场景,围绕一个核心假设展开:按治疗常规在第三磨牙拔除过程中使用阿莫西林(250 mg,每日三次,连续五天)会导致稳定的口腔微生物组发生显著改变。研究以口腔微生物组为主要观察对象,通过16S rDNA基因测序评估5个指定时间点不同细菌的相对丰度,并结合已知耐药基因微阵列与功能宏基因组学,分析已知抗生素耐药基因的相对丰度与表达;次要观察包括唾液C反应蛋白水平反映的口腔炎症,以及治疗前及治疗后第一周内的临床体征与症状,用于监测炎症和感染情况。该数据集适合用于口腔微生物组、抗生素使用影响及耐药基因研究等方向。
【数据集背景】
阻生第三磨牙拔除是口腔临床常见操作,治疗过程中常按方案常规使用阿莫西林。该数据集所对应的研究关注这种常规用药是否会对口腔中原本稳定的微生物群落造成显著扰动。其研究假设明确提出,阿莫西林(250 mg,每日三次,连续五天)作为第三磨牙拔除治疗方案的常规组成部分,会引起稳定口腔微生物组的显著改变。数据集主题标签为“Impacted Third Molar Tooth”,本站分类为感染性疾病/其他,来源站为clinicaltrials.gov。
【数据内容】
数据内容围绕主要结局指标和次要结局指标组织。主要结局指标包括两项:一是通过口腔微生物组16S rDNA基因测序,评估5个指定时间点不同细菌的相对丰度;二是通过已知耐药基因微阵列和功能宏基因组学,评估已知抗生素耐药基因的相对丰度和表达。次要结局指标包括:通过测量唾液中C反应蛋白水平,在2个时间点评估口腔内炎症的存在;以及观察治疗前和治疗后第一周内的临床体征与症状,以监测炎症和感染的存在。源站描述在“Subj”处截断,后续内容未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于clinicaltrials.gov。源站描述提及的条件为阻生第三磨牙(Impacted Third Molar Tooth),研究涉及阿莫西林用药、第三磨牙拔除、口腔微生物组采样与16S rDNA基因测序、耐药基因微阵列与功能宏基因组学分析,以及唾液C反应蛋白检测和临床体征症状观察。关于样本量、采集地点、采集时间窗、受试者招募方式等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于探讨阻生第三磨牙拔除围手术期常规使用阿莫西林对口腔微生物组稳定性的影响,适合口腔微生物组研究、抗生素暴露与耐药基因表达分析、术后炎症与感染监测等方向。其时间点设计和多组学检测思路,也可为相关临床微生物研究的设计提供参考。具体适用研究类型和适用范围,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供数据访问方式、文件格式、字段结构、使用许可或分析流程等使用说明。源站描述仅说明了研究假设、主要结局指标和次要结局指标,未给出数据下载或申请的具体指引。
【质量与限制】
源站描述在“Subj”处截断,部分研究信息不完整。关于样本量、缺失数据、测序深度、微阵列检测范围、质量控制措施及统计分析方法等,源站未提供。该数据集聚焦阻生第三磨牙拔除并使用阿莫西林的人群,结论外推至其他人群或其他抗生素方案时需谨慎,具体限制源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、数据许可协议或使用条款等信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT02951676
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:阻生第三磨牙。假设:阿莫西林疗程(250毫克,每日三次,持续五天),作为第三磨牙拔除治疗方案的常规组成部分,会导致稳定的口腔微生物组发生显著变化。主要结局指标是评估:1. 通过口腔微生物组16S rDNA基因测序评估的5个特定时间点不同细菌的相对丰度。2. 通过已知耐药基因微阵列和功能宏基因组学评估的已知抗生素耐药基因的相对丰度和表达。次要结局指标是评估:1. 通过测量2个时间点唾液中C反应蛋白水平来评估口腔内炎症的存在。2. 治疗前及治疗后第一周内的临床体征和症状,以监测炎症和感染的存在。计划进行常规手术拔牙并书面同意参与研究的受试者将被招募。一位具有颌面外科专科培训经验的临床操作者(ML Co-A)将负责执行临床治疗。
抗生素处方将依据病例复杂程度、手术操作难度及所需时间而定。因此,患者不会进行随机分组,而是每组纳入15例患者。本研究并非干预性研究,且不存在高风险组,因为患者接受的是预期的标准诊疗。唾液将在七个观察时间点采集(基线、一周、两周、三周、一个月、三个月和六个月),龈上菌斑样本将在四个观察时间点采集(基线、一周、一个月、三个月)。另将招募15名未接受拔牙或抗生素治疗的受试者作为对照组,在获得知情同意后纳入,并按相同的七个时间点进行随访。受试者将被要求避免刷
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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