GSE96689:RNA-seq检测自发再激活过程中EBV晚期转录的药理抑制
数据覆盖EBV再激活过程中的基因表达变化,包含1个文件(GSE96689_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL23185平台和9606物种

基本信息
资源简介
GSE96689:RNA-seq检测自发再激活过程中EBV晚期转录的药理抑制
RNA-seq detects pharmacological inhibition of Epstein-Barr virus late transcription during spontaneous reactivation.
该数据集来自NCBI Gene Expression Omnibus(GSE96689),利用RNA-seq检测Epstein-Barr virus(EBV)自发再激活过程中晚期转录的药理抑制。数据覆盖EBV再激活过程中的基因表达变化,包含1个文件(GSE96689_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL23185平台和9606物种。该数据可用于功能鉴定EBV真正晚期基因、研究病毒转录调控及再激活机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 16 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):病毒基因的逐步和顺序表达是感染性生命周期进展的基础。Epstein-Barr病毒(EBV)既是阐明转录原理的可操作模型,也是全球健康威胁。我们描述了一种实验方案和生物信息学流程,用于功能鉴定EBV真正晚期基因,即病毒粒子包装和出胞前的最后转录步骤。所有数据已上传至Gene Expression Omnibus,登录号为GSE96689。与先前方法相比的关键改进是利用RNA-seq的灵敏度来检测自发再激活期间的基因表达变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL23185、9606。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE96689
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE96689
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
病毒基因的逐步和顺序表达是感染性生活周期进展的基础。Epstein-Barr病毒(EBV)既是阐明转录原理的易处理模型,也是全球健康威胁。我们描述了一种实验方案和生物信息学流程,用于功能鉴定EBV真正的晚期基因,即病毒粒子包装和出胞之前的转录最后一步。所有数据已上传至Gene Expression Omnibus,登录号为GSE96689。与以往方法相比的关键改进是利用RNA-seq的灵敏度来检测自发再激活过程中的基因表达变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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