ApoE-/-/Ch25h-/-小鼠腹腔巨噬细胞转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE90983

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胆固醇25-羟化酶（Ch25h）此前已被证明是抗炎作用和抗病毒活性所必需的，同时还能促进泡沫细胞形成。为了阐明Ch25h在动脉粥样硬化中的作用，我们从缺乏ApoE和Ch25h的小鼠（即ApoE-/-/Ch25h-/-）及其野生型同窝对照小鼠（即ApoE-/-/Ch25h+/+）中分离腹腔巨噬细胞（PMs）进行转录组分析，设生物学重复（每组n=12只合并小鼠）。深度测序分析显示，Ch25h缺失的PMs倾向于促炎性M1表型，并伴有胆固醇生物合成增加。总体而言，我们发现Ch25h通过维持M2极化和抑制细胞内胆固醇含量，对动脉粥样硬化保护至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。