饮食麸质诱导的恒河猴乳糜泻模型肠道菌群失调与microRNA上调数据集
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov,包含1个文件(GSE89170_series_matrix.txt.gz),基于RT-PCR表达谱分析,研究恒河猴乳糜泻模型中饮食麸质诱导的肠道菌群失调及microRNA选择性上调

基本信息
资源简介
饮食麸质诱导的恒河猴乳糜泻模型肠道菌群失调与microRNA上调数据集
Dietary Gluten-Induced Gut Dysbiosis is Accompanied by Selective Upregulation of microRNAs with Intestinal Tight Junction and Bacteria-Binding Motifs in Rhesus Macaque Model of Celiac Disease
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov,包含1个文件(GSE89170_series_matrix.txt.gz),基于RT-PCR表达谱分析,研究恒河猴乳糜泻模型中饮食麸质诱导的肠道菌群失调及microRNA选择性上调。数据覆盖麸质喂养后空肠组织中miRNA表达变化,可用于探索miRNA调控肠道紧密连接蛋白、增加肠道通透性及促进菌群易位的机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 25 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该研究描述了在麸质敏感(GS)恒河猴喂食含麸质的猴粮后,完整空肠中miRNA的表达情况。麸质喂养诱导了若干与炎症相关的miRNA,这些miRNA经验证和预测可直接靶向肠道紧密连接蛋白。这些microRNA的上调伴随着claudin-1、claudin-3和occludin的mRNA表达显著降低以及严重的肠道菌群失调。这些发现表明,miRNA介导的肠道上皮紧密连接蛋白下调可能增加肠道通透性,并促进失调细菌易位进入体循环。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by RT-PCR、GPL17837、9544。本站分类:感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89170
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 26 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
该研究描述了在给麸质敏感(GS)恒河猴喂食含麸质的猴粮后,完整空肠中miRNA的表达情况。麸质喂养诱导了若干与炎症相关的miRNA,这些miRNA经验证和预测可直接靶向肠道紧密连接蛋白。这些microRNA的上调伴随着claudin-1、claudin-3和occludin mRNA表达的显著降低以及严重的肠道菌群失调。这些发现提示,miRNA介导的肠上皮紧密连接蛋白下调可能增加肠道通透性,并促进失调细菌易位进入体循环。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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