BET抑制剂抑制BZLF1表达 [MutuI RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84209

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EBV的裂解性感染带来诸多健康风险，如传染性单核细胞增多症和淋巴增殖性疾病。我们证明，JQ1及其他BET抑制剂可阻断EBV生命周期级联过程中的两个不同步骤：即早期即刻基因BZLF1的表达和裂解性基因组复制。这代表了一类新型抗病毒药物的作用机制，可能提高疗效并减少耐药性的产生。以下RNA-seq数据显示，JQ1的第一个阻断作用发生在任何EBV裂解基因转录之前（参见EBV转录组的wig图）。我们检查了同一RNA-seq数据的一个子集（Mutu+vehicle与Mutu+JQ1各三个重复），以了解人类转录组的变化，结果呈现在电子表格“Differential_Expression_GEO”中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。