GSE67345：Cottontail rabbit papillomavirus E2蛋白调控基因的鉴定
该数据集来自NCBI GEO，标题为Cottontail rabbit papillomavirus E2蛋白调控基因的鉴定，属于感染性疾病/其他分类
基本信息
资源简介
GSE67345：Cottontail rabbit papillomavirus E2蛋白调控基因的鉴定
GSE67345 数据集来自 NCBI GEO，标题为“Identification of Cottontail rabbit papillomavirus E2 protein regulated genes”，即兔乳头瘤病毒 E2 蛋白调控基因的鉴定。该数据集属于感染性疾病 / 其他分类，围绕转录组分析展开，研究者在多西环素诱导 CRPV E2 表达后，对 C33a 细胞的 RNA 进行表达谱检测。数据集以芯片表达谱分析为主题，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE67345_series_matrix.txt.gz，作者为 Maria，Delcuratolo，发布时间为 Mar 27 201。整体而言，该数据集提供了一个研究病毒蛋白调控宿主细胞基因表达的资源，适合关注病毒感染性疾病分子机制的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集聚焦于兔乳头瘤病毒（Cottontail rabbit papillomavirus，CRPV）E2 蛋白所调控基因的鉴定。E2 蛋白是乳头瘤病毒编码的重要调控蛋白，通常参与病毒基因转录调控和宿主细胞基因表达的改变。源站描述指出，该研究通过多西环素诱导 CRPV E2 在 C33a 细胞中表达，并对诱导后的 RNA 进行转录组分析，以识别受 E2 蛋白调控的基因。数据集被归入感染性疾病 / 其他分类，主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6244 和 9606，说明其采用芯片表达谱技术，涉及人类（9606）样本背景，并使用 GPL6244 对应的芯片平台。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE67345_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件，通常用于汇总表达谱芯片实验的样本信息和基因表达数值。源站描述表明，数据内容来自 C33a 细胞在多西环素诱导 CRPV E2 表达后的 RNA 转录组分析，因此文件中的表达数据应反映诱导前后或相关条件下的基因表达变化。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据属于芯片表达谱类型，GPL6244 指向所使用的芯片平台，9606 则指向人类样本分类。除上述信息外，源站未提供更详细的样本数量、分组设计或基因数量等具体内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。源站标题与数据集英文名一致，均为“Identification of Cottontail rabbit papillomavirus E2 protein regulated genes”。作者为 Maria，Delcuratolo，发布时间为 Mar 27 201。源站描述说明，实验材料为 C33a 细胞，通过多西环素诱导 CRPV E2 表达，随后对 RNA 进行转录组分析。数据集的分类为感染性疾病 / 其他，主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6244 和 9606。除这些信息外，源站未提供更详细的采集地点、实验批次或测序/芯片操作流程。
【适用场景】
该数据集适用于研究兔乳头瘤病毒 E2 蛋白对宿主细胞基因表达调控的影响，也可用于感染性疾病相关转录组数据的比较分析。由于主题标签包含 Expression profiling by array 和 GPL6244，该数据适合作为芯片表达谱分析的参考数据，用于探索 E2 蛋白诱导后基因表达变化模式。此外，该数据集可用于方法学验证，例如在小样本上核对字段与编码、测试表达谱数据处理流程，或作为感染性疾病 / 其他分类下的示例数据。源站未提供该数据集在其他具体研究场景中的使用说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE67345_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需按 GZIP 格式解压或使用支持 GZIP 的工具直接读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认文件结构、样本标识和表达数值格式无误后，再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件，使用时应以该系列矩阵文件为主要数据来源。源站未提供具体的分析软件、参数设置或标准化方法，使用者需根据自身分析需求选择合适工具。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据规模有限，且源站未提供样本数量、重复设置、数据完整性或质控指标等详细信息。主题标签显示其基于芯片表达谱平台 GPL6244，涉及人类样本分类 9606，但源站未提供具体的芯片杂交质量、背景校正或归一化处理说明。发布时间为 Mar 27 201，源站未提供后续更新记录。使用者在分析前应自行核对文件字段与编码，并注意数据集仅覆盖 CRPV E2 表达诱导后的 C33a 细胞转录组分析，不宜直接外推到其他细胞类型或病毒蛋白。源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Maria，Delcuratolo，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款。使用者在引用或再利用该数据集时，应参考 NCBI GEO 的通用引用规范，并自行确认源站的相关使用政策。源站未提供其他引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE67345
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Transcriptome analyses of RNA from C33a cells after induction of CRPV E2 expression by doxycycline
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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