宿主遗传多样性促成实验性埃博拉出血热发病机制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57214

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数据说明

扎伊尔埃博拉病毒（ZEBOV）是已知最致命的人类病原体之一，可引起严重的出血热，病死率高达70-90%。由于缺乏有效的疫苗或治疗方法，ZEBOV被视为重大的全球生物防御威胁，当前西非爆发的高致死性新型ZEBOV变异株疫情便是有力证明。现有的致死性ZEBOV感染小鼠模型无法重现埃博拉出血热（EHF）的标志性症状，包括血液凝固时间延长、急性肝炎、弥散性血管内凝血（DIC）以及出血性休克导致的死亡，因此致病机制研究仅限于非人灵长类动物（NHP）。这阻碍了在疫情爆发场景下快速评估应对措施，也妨碍了全面理解宿主对感染的反应如何促成严重EHF疾病。在此，我们证明，来自协作交叉（CC）的小鼠——一组可重复、重组近交系动物，涵盖三个小鼠亚种的遗传广度——在ZEBOV感染后对一系列疾病表型易感。

与C57Bl6/J小鼠不同——后者会发展为致死性疾病但无EHF症状——CC重组近交杂交（CC-RIX）品系或表现为对致死性疾病的完全抵抗，或表现为以凝血时间延长和100%死亡率为特征的严重EHF。疾病抵抗与存活不依赖于病毒嗜性，因为抵抗品系和EHF易感品系在靶器官中均表现出相似的炎症和细胞病变效应。转录组学揭示了潜在机制：一方面，IL-6和血管激活介导EHF中严重出血的诱导；另一方面，通过诱导淋巴细胞分化和细胞黏附实现对致死性感染的抵抗。这些数据表明，特定于独特遗传背景的宿主反应决定了出血综合征的易感性，且独立于病毒复制。CC代表

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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